Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 RAB28P3-201ENST00000448325 597 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SP140Q13342 OR52I1-201ENST00000450052 1050 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SP140Q13342 HMGB1P26-201ENST00000452520 628 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SP140Q13342 AL450263.1-202ENST00000453199 643 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SP140Q13342 AL158069.1-201ENST00000454131 455 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SP140Q13342 SNX18P26-201ENST00000458433 740 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SP140Q13342 AC022730.1-201ENST00000473114 568 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SP140Q13342 CNOT10-AS1-201ENST00000475395 466 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SP140Q13342 AC087071.2-201ENST00000483283 575 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SP140Q13342 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SP140Q13342 NPM1P27-201ENST00000502784 830 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SP140Q13342 AC108159.1-201ENST00000505408 489 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SP140Q13342 Vault.2-201ENST00000516519 98 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SP140Q13342 AP001978.1-201ENST00000526851 834 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SP140Q13342 AC020611.2-201ENST00000535594 671 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SP140Q13342 LINC02454-201ENST00000539116 589 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SP140Q13342 AC025918.2-201ENST00000558683 763 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SP140Q13342 AP3S2-214ENST00000560940 519 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SP140Q13342 AC217774.1-201ENST00000578936 517 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SP140Q13342 TVP23B-209ENST00000581733 1258 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SP140Q13342 AC090283.1-201ENST00000582101 265 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
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SP140Q13342 AP000919.2-202ENST00000584431 673 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
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SP140Q13342 AC011497.2-201ENST00000600255 639 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SP140Q13342 AC079880.2-201ENST00000603790 1213 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SP140Q13342 AL355493.4-201ENST00000618530 292 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SP140Q13342 MIR6849-201ENST00000618543 69 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SP140Q13342 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SP140Q13342 AC093875.1-201ENST00000623688 504 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SP140Q13342 AL049767.1-201ENST00000636811 514 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SP140Q13342 DCX-207ENST00000635795 9163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
SP140Q13342 ESF1-201ENST00000202816 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SP140Q13342 ZMYM2-210ENST00000610343 10200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
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SP140Q13342 AC105105.2-201ENST00000590797 4521 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SP140Q13342 ASTN2-AS1-201ENST00000418250 1756 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SP140Q13342 RARB-204ENST00000458646 2590 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
SP140Q13342 ALS2CR12-203ENST00000405148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
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SP140Q13342 RNA5SP96-201ENST00000516041 107 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
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SP140Q13342 AC022915.3-201ENST00000518620 594 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
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SP140Q13342 AP005639.1-201ENST00000526939 192 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SP140Q13342 AP000873.2-205ENST00000529031 435 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SP140Q13342 KLRD1-209ENST00000543420 802 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
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SP140Q13342 AC063947.1-201ENST00000549036 557 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SP140Q13342 PPFIA2-AS1-210ENST00000553197 875 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SP140Q13342 AC112693.1-201ENST00000555297 682 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SP140Q13342 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SP140Q13342 AC008752.1-201ENST00000590046 408 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SP140Q13342 AL022067.1-201ENST00000602426 454 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SP140Q13342 AC036176.3-201ENST00000602456 418 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SP140Q13342 AC005034.4-201ENST00000603612 899 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
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