Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AC078883.1-203ENST00000416080 654 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AL390036.1-201ENST00000419428 734 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AL139415.1-201ENST00000424862 352 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AC010978.1-202ENST00000427050 893 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 PAICSP2-201ENST00000429118 1150 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 MIR181A1HG-202ENST00000432296 930 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 RPL3P11-201ENST00000434028 1146 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 ELOCP10-201ENST00000440624 327 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 RPL23AP28-201ENST00000448062 470 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AL354989.1-201ENST00000448245 635 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AL135933.1-201ENST00000498657 802 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AC114324.2-202ENST00000503812 134 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AC023866.2-201ENST00000521378 387 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AP003059.1-201ENST00000526206 432 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AC079917.1-201ENST00000527828 584 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AC079917.1-202ENST00000534059 625 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AL135838.1-201ENST00000556080 235 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 ADAMTS7P4-205ENST00000560651 453 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AC026458.1-201ENST00000564330 438 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 MIR4312-201ENST00000579909 76 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 MIR4428-201ENST00000584884 73 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AC020915.3-201ENST00000595301 550 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AC239809.3-206ENST00000596091 741 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AC005229.3-201ENST00000603438 323 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 ELOCP34-201ENST00000604436 327 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AL499605.1-201ENST00000604628 403 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 KATNBL1P1-201ENST00000605192 748 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AL121830.1-206ENST00000608476 1254 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 FAM13A-AS1_2.1-201ENST00000611121 108 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 PLSCR2-207ENST00000613069 1208 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AC015574.1-202ENST00000616588 456 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 LINC01676-209ENST00000623043 896 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AC020763.5-201ENST00000623298 430 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 LINC01206-233ENST00000630063 878 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AC005674.2-201ENST00000561486 3510 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 GRPR-201ENST00000380289 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AC017002.4-201ENST00000604721 1525 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 ALG13-203ENST00000394780 4133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AL603750.1-201ENST00000624216 1717 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 TYW3-203ENST00000457880 3335 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AC134980.1-209ENST00000639059 2317 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 PLEKHA5-216ENST00000540972 1954 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 CLDN10-201ENST00000299339 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 OR14C36-201ENST00000317861 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 TRAV13-1-201ENST00000390436 360 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AL512430.2-201ENST00000406786 339 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 BCL11A-205ENST00000409351 756 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AC009965.1-201ENST00000411436 570 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AC084816.1-201ENST00000413794 565 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 OR13C7-201ENST00000424348 959 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 NAP1L4P2-201ENST00000425958 899 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AL031428.1-201ENST00000427154 666 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 MRPS33P4-201ENST00000434892 317 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AL451136.1-201ENST00000435399 325 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 GPC6-AS1-201ENST00000436329 698 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AL159174.1-201ENST00000438267 811 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 ZNF138-205ENST00000440155 1066 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AC005772.1-201ENST00000446671 976 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 EEF1B2P3-201ENST00000447718 678 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AL358075.1-201ENST00000450004 649 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AL392046.1-201ENST00000450742 569 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AC016722.1-201ENST00000453936 652 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 MED28P7-201ENST00000456611 530 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AC079193.1-201ENST00000460497 588 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 RPSAP37-201ENST00000470913 821 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 METTL15P1-201ENST00000481421 1045 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 RN7SL568P-201ENST00000493069 298 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 PFN1P8-201ENST00000497012 543 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 SNORA58-201ENST00000505219 137 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AC008906.1-201ENST00000512856 993 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 IGKV2D-38-201ENST00000518423 240 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 BPIFA4P-204ENST00000605211 656 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AC073111.2-201ENST00000605657 1075 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 DARS-AS1-221ENST00000608471 532 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AP005131.7-201ENST00000610087 611 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 OR1N1-202ENST00000619659 939 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AP003497.2-201ENST00000624220 967 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AL354702.2-202ENST00000641481 890 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AC062029.1-202ENST00000606164 3651 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 GJA10-203ENST00000638915 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.9 ms