Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 LINC00102-201ENST00000445785 1340 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 CACNA1E-202ENST00000358338 14700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 FOXP2-204ENST00000390668 1472 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 CCDC186-203ENST00000369287 7245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 BRWD3-201ENST00000373275 11381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 PMS2-203ENST00000382321 1386 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 AC005261.6-201ENST00000623072 1387 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 NCOA4P2-201ENST00000340589 1813 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 SETDB2-201ENST00000258672 2138 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 RAB3B-201ENST00000371655 12844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 BPY2-201ENST00000331070 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 RN7SKP128-201ENST00000364270 303 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 RN7SKP78-201ENST00000364711 318 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 BPY2C-201ENST00000382287 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 BPY2B-201ENST00000382392 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 LSM5-203ENST00000409782 649 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 LINC01980-201ENST00000414382 543 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 RPL23AP18-201ENST00000416139 468 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 LINC00626-201ENST00000420691 955 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 AC069154.1-201ENST00000432914 542 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 MEOX2-AS1-201ENST00000442176 697 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 CYP3A43-210ENST00000444905 733 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 MTND6P5-201ENST00000448266 512 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 AC093166.4-201ENST00000457867 318 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 AC105420.1-201ENST00000504389 582 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 AC025458.1-201ENST00000506046 166 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 OR5H7P-201ENST00000514084 930 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 Y_RNA.667-201ENST00000516212 107 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 IGHVIII-47-1-201ENST00000518187 331 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 H2AFV-208ENST00000521529 439 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 AC010768.4-201ENST00000528183 520 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 CREBZF-209ENST00000534224 545 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 AC078814.2-201ENST00000552996 535 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 AL356801.1-201ENST00000559320 294 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 ST20-203ENST00000562759 694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 AC007346.2-201ENST00000564816 892 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 AC023389.2-201ENST00000580031 955 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 RPL12P48-201ENST00000605620 304 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 Six3os1_2.1-201ENST00000616963 217 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 AC245014.3-201ENST00000618589 347 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 OR8G5-203ENST00000641992 1560 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 AC004014.2-201ENST00000623718 5122 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 GLYATL1-201ENST00000300079 2068 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 AADAT-202ENST00000353187 2101 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 DDX18P6-201ENST00000450119 1997 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 ZNF81-204ENST00000376954 7933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 PAK3-203ENST00000372007 8940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 ENSA-214ENST00000513281 1369 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 HTR2A-202ENST00000542664 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 AC123769.1-201ENST00000530992 3192 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 UGT2B15-201ENST00000338206 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 JAKMIP2-205ENST00000507386 5915 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 SPATA6-202ENST00000371843 2297 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 PRIM2-201ENST00000274891 864 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 LYPD6B-201ENST00000280115 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 REP15-201ENST00000310791 1078 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 AC004386.1-201ENST00000393214 761 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 CXADRP1-201ENST00000398098 1095 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 KCNJ13-202ENST00000409779 1099 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 AC066692.1-201ENST00000421721 457 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 ATP5A1P8-201ENST00000423669 1291 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 YY1P1-201ENST00000427625 668 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 LINC01363-202ENST00000428030 930 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 BX323845.3-201ENST00000428215 527 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 AC008063.2-201ENST00000432251 619 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 RAET1E-AS1-201ENST00000446954 491 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 OSTCP1-201ENST00000455507 450 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 LINC01487-201ENST00000462531 905 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 AC011405.1-204ENST00000512875 731 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 snoU109.5-201ENST00000516231 132 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 AC091185.1-201ENST00000523840 528 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 ALG9-IT1-201ENST00000531305 684 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD13P35453 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
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