Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 AC009120.2-204ENST00000621548 2032 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 MAPK10-365ENST00000641902 3825 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 CCDC80-201ENST00000206423 12430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 DAZ3-202ENST00000382365 3503 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
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HOXD10P28358 MS4A6A-202ENST00000420732 863 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
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HOXD10P28358 AC024940.4-201ENST00000605507 246 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
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HOXD10P28358 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 IL5RA-207ENST00000438560 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
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HOXD10P28358 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
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HOXD10P28358 CNOT1-202ENST00000441024 4999 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
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HOXD10P28358 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 TNKS-206ENST00000518281 3897 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
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HOXD10P28358 AL442071.1-201ENST00000289890 558 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
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HOXD10P28358 PGM5-AS1-202ENST00000420855 572 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
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HOXD10P28358 AC079117.1-201ENST00000445178 1000 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
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HOXD10P28358 AC004453.1-201ENST00000487895 408 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 RPS26P24-201ENST00000497656 331 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 HIGD1AP14-201ENST00000507617 282 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 AC006296.2-201ENST00000507932 764 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 IGHV1-14-201ENST00000523391 241 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 LGALS8-217ENST00000525042 903 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 ANP32E-205ENST00000533654 908 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 PIWIL4-203ENST00000537419 831 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 AC024224.2-201ENST00000544225 782 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
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