Protein–RNA interactions for Protein: O00192

ARVCF, Armadillo repeat protein deleted in velo-cardio-facial syndrome, humanhuman

Predictions only

Length 962 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARVCFO00192 CSNK1A1P1-202ENST00000563423 981 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
ARVCFO00192 AC124283.4-201ENST00000581815 456 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
ARVCFO00192 LINC01908-201ENST00000583148 555 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
ARVCFO00192 MIR4443-201ENST00000585052 53 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
ARVCFO00192 AC008751.2-201ENST00000597885 980 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
ARVCFO00192 SNHG8-202ENST00000602483 309 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
ARVCFO00192 AC012213.4-201ENST00000606457 354 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
ARVCFO00192 AC025171.4-201ENST00000607250 1047 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
ARVCFO00192 Metazoa_SRP.94-201ENST00000612609 250 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
ARVCFO00192 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
ARVCFO00192 AL355493.4-201ENST00000618530 292 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
ARVCFO00192 AC006927.2-201ENST00000639256 389 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
ARVCFO00192 KLRD1-203ENST00000350274 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
ARVCFO00192 SNX25-202ENST00000504273 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
ARVCFO00192 MAK-202ENST00000354489 3941 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
ARVCFO00192 CYP3A5-201ENST00000222982 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
ARVCFO00192 ALS2CR12-203ENST00000405148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
ARVCFO00192 TRIM49-201ENST00000329758 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
ARVCFO00192 TRIM49C-201ENST00000448984 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
ARVCFO00192 NUDT13-206ENST00000537969 2151 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
ARVCFO00192 TRIM49B-202ENST00000622138 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
ARVCFO00192 RPGRIP1L-202ENST00000379925 5297 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
ARVCFO00192 TRIM34-201ENST00000429814 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
ARVCFO00192 FOCAD-216ENST00000605086 4195 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
ARVCFO00192 AL390726.6-201ENST00000637760 1654 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
ARVCFO00192 ZNF474-201ENST00000296600 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
ARVCFO00192 OR2T2-203ENST00000642130 3331 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
ARVCFO00192 GART-204ENST00000381831 3490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
ARVCFO00192 ZNF181-204ENST00000492450 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
ARVCFO00192 LARS-212ENST00000510191 3737 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ARVCFO00192 NCAPH-205ENST00000455200 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ARVCFO00192 RSAD2-201ENST00000382040 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
ARVCFO00192 COX7B-203ENST00000481445 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
ARVCFO00192 TMC5-206ENST00000561503 2487 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ARVCFO00192 RARSP1-201ENST00000542842 1418 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ARVCFO00192 TMSB4XP4-201ENST00000323496 618 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ARVCFO00192 POU1F1-201ENST00000344265 1149 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ARVCFO00192 RNA5SP346-201ENST00000363541 121 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ARVCFO00192 RPL34-203ENST00000394668 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
ARVCFO00192 TAF9BP2-201ENST00000400856 499 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ARVCFO00192 MIR1204-201ENST00000408388 67 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ARVCFO00192 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ARVCFO00192 UBE2V1P9-201ENST00000414760 368 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ARVCFO00192 MTCO2P21-201ENST00000419780 677 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ARVCFO00192 TEX41-203ENST00000420472 765 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ARVCFO00192 AC115285.1-201ENST00000424879 736 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ARVCFO00192 AC130360.1-201ENST00000425489 1117 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ARVCFO00192 AL161636.2-201ENST00000445179 927 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ARVCFO00192 AC117386.1-201ENST00000474444 606 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ARVCFO00192 RN7SL326P-201ENST00000477493 296 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ARVCFO00192 RPL34P33-201ENST00000486062 334 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ARVCFO00192 EIF1P7-201ENST00000487533 337 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ARVCFO00192 HMGB1P38-201ENST00000490557 577 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ARVCFO00192 SPTSSB-202ENST00000497137 880 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ARVCFO00192 MTND6P8-201ENST00000503471 522 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ARVCFO00192 AC108866.1-204ENST00000508362 558 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ARVCFO00192 NPY1R-204ENST00000509586 1017 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ARVCFO00192 ZNF131-215ENST00000509931 970 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ARVCFO00192 LINC02267-202ENST00000522173 799 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ARVCFO00192 AC130365.2-201ENST00000525882 1201 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ARVCFO00192 AP000873.2-204ENST00000530825 375 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ARVCFO00192 KBTBD3-204ENST00000531482 874 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ARVCFO00192 AC091515.1-201ENST00000548110 679 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ARVCFO00192 AC068305.2-201ENST00000550567 1205 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ARVCFO00192 VPS29-210ENST00000552130 1057 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
ARVCFO00192 AC092134.1-201ENST00000563690 800 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ARVCFO00192 AC135050.4-201ENST00000568708 504 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ARVCFO00192 AC007014.1-201ENST00000572828 610 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ARVCFO00192 AC087301.1-201ENST00000579037 321 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ARVCFO00192 AP001357.1-201ENST00000586304 1053 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ARVCFO00192 NPIPB1P-202ENST00000588786 828 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ARVCFO00192 BNIP3P24-201ENST00000593398 557 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ARVCFO00192 AC012370.2-201ENST00000597541 1080 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ARVCFO00192 AC068768.2-201ENST00000602352 343 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ARVCFO00192 AL022067.1-201ENST00000602426 454 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ARVCFO00192 AL157899.1-201ENST00000604110 936 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ARVCFO00192 CT45A7-201ENST00000610598 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
ARVCFO00192 AC005393.1-201ENST00000617916 584 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ARVCFO00192 AL512652.1-201ENST00000619006 500 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ARVCFO00192 PCBP1-AS1-286ENST00000625888 765 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ARVCFO00192 AC083865.1-201ENST00000636634 831 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ARVCFO00192 CASC18-202ENST00000548557 2503 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
ARVCFO00192 NLRP4-203ENST00000587891 3201 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ARVCFO00192 AL157831.2-201ENST00000564681 3095 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ARVCFO00192 PLEKHA1-205ENST00000433307 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
ARVCFO00192 SLC26A5-205ENST00000393723 2174 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
ARVCFO00192 AL627309.5-201ENST00000484859 4860 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ARVCFO00192 ZNF573-201ENST00000339503 2014 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ARVCFO00192 SLC26A7-202ENST00000309536 2656 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
ARVCFO00192 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
ARVCFO00192 AL590542.1-201ENST00000449314 1596 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
ARVCFO00192 AC011503.1-201ENST00000596326 1585 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
ARVCFO00192 VCAN-202ENST00000342785 7154 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
ARVCFO00192 MAPK10-251ENST00000640858 3052 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
ARVCFO00192 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
ARVCFO00192 FDCSP-201ENST00000317987 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
ARVCFO00192 IFNA10-201ENST00000357374 963 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
ARVCFO00192 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
ARVCFO00192 AL034376.1-201ENST00000380106 484 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
ARVCFO00192 AL022100.2-201ENST00000422548 389 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.7 ms