Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 KCNH7-205ENST00000621889 1893 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 CETN2-201ENST00000370277 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 AL353743.3-201ENST00000442109 1468 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 AC092111.2-201ENST00000611627 1414 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 H3F3A-201ENST00000366813 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 ZEB2-AS1-202ENST00000427278 1322 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC4.33□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 IL6STP1-201ENST00000346911 1020 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 SLC30A7-201ENST00000357650 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
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LINC00587B1AMM8 RNA5SP132-201ENST00000364725 118 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 STMN1-202ENST00000374291 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 RPS3AP5-201ENST00000389400 821 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 HNRNPCP2-201ENST00000399515 881 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 C14orf2-202ENST00000414262 842 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 LINC01704-201ENST00000414848 834 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 Z93019.1-201ENST00000416450 973 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 AL359092.1-201ENST00000417156 265 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 AL035401.1-201ENST00000420572 871 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 IGKV3OR2-268-201ENST00000421835 350 ntAPPRIS P1 BASIC4.33□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 OR5AC1-201ENST00000429239 925 ntAPPRIS P1 BASIC4.33□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 AL357520.1-201ENST00000441557 453 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 OSBPL10-AS1-205ENST00000444503 526 ntTSL 4 BASIC4.33□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 BX119904.2-201ENST00000446495 512 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 AC022080.2-201ENST00000452932 533 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 AC124945.1-201ENST00000485133 188 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 AC090673.1-204ENST00000504038 977 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 LINC01339-201ENST00000505712 440 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 AC021146.3-201ENST00000511911 260 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 EIF3KP1-201ENST00000513279 656 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 AC093599.1-201ENST00000515232 562 ntTSL 4 BASIC4.33□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 BFSP2-AS1-201ENST00000515542 894 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 RNA5SP303-201ENST00000516192 130 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
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LINC00587B1AMM8 AC021820.1-201ENST00000525564 808 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 GLYATL1P4-201ENST00000529326 906 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 DDHD2-219ENST00000529845 945 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
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LINC00587B1AMM8 WBP2NL-210ENST00000543212 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
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LINC00587B1AMM8 RNASE11-206ENST00000553849 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
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LINC00587B1AMM8 AC068254.1-201ENST00000584753 483 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
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LINC00587B1AMM8 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
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LINC00587B1AMM8 AC026108.1-201ENST00000635444 547 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
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LINC00587B1AMM8 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
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LINC00587B1AMM8 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 AL162456.1-201ENST00000634535 2006 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
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LINC00587B1AMM8 TFG-204ENST00000476228 1783 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 SLC38A9-218ENST00000512595 1756 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 C17orf78-203ENST00000611038 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 AL355306.2-205ENST00000635395 1646 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 GMFG-201ENST00000253054 616 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 GPR15-201ENST00000284311 1252 ntAPPRIS P1 BASIC4.32□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 OR8H3-201ENST00000313472 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.32□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 VTRNA3-1P-201ENST00000362552 102 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 C1orf54-203ENST00000369102 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 MCTS1-202ENST00000371317 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 MYO3A-202ENST00000376301 727 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 UBBP1-201ENST00000392399 473 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 GAPDHP15-201ENST00000398586 975 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 MTIF3-203ENST00000405591 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 AL929472.1-201ENST00000417484 429 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 LINC01980-202ENST00000425195 491 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 APCDD1L-AS1-204ENST00000427794 461 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 LINC01221-201ENST00000432488 662 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 AL357314.1-201ENST00000433521 806 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 BSNDP4-201ENST00000436076 388 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 AC009518.3-201ENST00000438972 253 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
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