Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 AL390774.1-201ENST00000411924 246 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 HMGB3P31-201ENST00000413333 595 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 AC012462.2-201ENST00000414756 391 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 AC012519.1-201ENST00000424588 610 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 AC092646.1-201ENST00000427142 901 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 FO393419.3-201ENST00000428741 282 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 POT1-AS1-203ENST00000435452 2147 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 LINC00570-203ENST00000437795 490 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 AC097499.1-201ENST00000444277 208 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 AC010240.2-201ENST00000445363 1205 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 AC108463.2-201ENST00000451230 412 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 AC005517.1-201ENST00000452091 489 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 LINC02541-202ENST00000452675 465 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 AL391863.1-202ENST00000457427 612 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 SNORA81.1-201ENST00000458922 177 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 H3F3AP5-201ENST00000475267 429 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 CFLAR-223ENST00000479953 1230 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 AP005202.1-201ENST00000489915 867 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 F11-205ENST00000492972 1204 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 AC016687.2-201ENST00000504795 541 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 SSX8-201ENST00000506270 579 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 AC110775.1-201ENST00000513721 462 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 AC022441.2-201ENST00000514113 382 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 AP003467.1-201ENST00000517397 301 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 AC097173.2-201ENST00000518701 474 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 AC114550.1-201ENST00000518846 573 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 HDAC2-AS2-209ENST00000519270 1244 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 HIGD1AP18-201ENST00000520730 278 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 AC099805.1-205ENST00000521794 837 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 AC107952.1-201ENST00000524200 376 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 AC022639.1-202ENST00000524360 581 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 AP001804.1-201ENST00000526868 919 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 ACRV1-203ENST00000530048 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 OR5M6P-201ENST00000530227 937 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 ZNF585B-204ENST00000531805 2971 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 AC092851.1-201ENST00000535964 478 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 AL158801.3-201ENST00000555514 363 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 AC020891.2-201ENST00000559672 776 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 AC126323.4-201ENST00000566935 234 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 MIR5708-201ENST00000579723 85 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 AC068020.1-201ENST00000594215 661 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 TEX41-218ENST00000596540 882 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 AC130352.1-201ENST00000602979 661 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 AC122710.3-201ENST00000606566 541 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 AP002345.2-201ENST00000609961 904 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 CLK4-214ENST00000611575 1206 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 AC243829.2-201ENST00000617914 470 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 AL035661.1-201ENST00000620459 1144 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 AL590240.3-201ENST00000621416 943 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 AC087894.3-201ENST00000623682 349 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 OR5D13-201ENST00000623930 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 ASB8-218ENST00000629941 278 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 AC006453.3-201ENST00000635891 377 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 MRPS27-201ENST00000261413 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 CFAP61-201ENST00000245957 4082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 MYO6-208ENST00000627432 4074 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 MDM4-203ENST00000367182 10073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 HSP90AA2P-201ENST00000530115 2196 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 SLC17A2-203ENST00000377850 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 CS-201ENST00000351328 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 CLEC7A-205ENST00000353231 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 C4orf26-201ENST00000311623 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 NCOA4P3-201ENST00000513203 1877 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 KYNUP2-201ENST00000582280 1329 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 DTNA-221ENST00000591182 1787 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 ASAH1-227ENST00000636455 1777 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 AC004014.2-201ENST00000623718 5122 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 PDGFRA-201ENST00000257290 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 ZNF333-203ENST00000540689 3595 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 DNAJC6-203ENST00000395325 5743 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 ELAVL4-202ENST00000371819 2467 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 KLHL2-202ENST00000421009 2452 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 GON4L-201ENST00000271883 7138 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 CCR2-204ENST00000445132 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 BRWD1-203ENST00000342449 12929 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 SEC23IP-208ENST00000543134 1461 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 IRF6-201ENST00000367021 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 KIAA0040-206ENST00000619513 4340 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 OR5M2P-202ENST00000641241 4242 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 MAPK10-323ENST00000641493 3207 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 SPRR2D-202ENST00000368756 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 RNA5SP53-201ENST00000391299 120 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 ZNF37CP-201ENST00000406795 241 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 AL139100.1-201ENST00000408001 498 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 MEAF6P1-201ENST00000416092 327 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 DLEU1-AS1-201ENST00000428276 731 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 GAS5-211ENST00000432536 959 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 AL606804.1-201ENST00000435333 538 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 AL139327.2-202ENST00000437057 400 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 AL591503.2-201ENST00000442314 1005 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms