Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 CD84-201ENST00000311224 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
BEST4Q8NFU0 UQCR10-201ENST00000330029 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
BEST4Q8NFU0 OR4Q3-201ENST00000331723 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
BEST4Q8NFU0 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BEST4Q8NFU0 STMN1-202ENST00000374291 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
BEST4Q8NFU0 TPT1-204ENST00000379060 764 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
BEST4Q8NFU0 SMPX-201ENST00000379494 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
BEST4Q8NFU0 MRPL32P1-201ENST00000406301 247 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BEST4Q8NFU0 MS4A6A-202ENST00000420732 863 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
BEST4Q8NFU0 LINC01031-201ENST00000420807 779 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
BEST4Q8NFU0 RPS15AP30-201ENST00000420976 390 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BEST4Q8NFU0 GPN3P1-201ENST00000423883 535 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BEST4Q8NFU0 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
BEST4Q8NFU0 AL138479.1-201ENST00000426913 484 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BEST4Q8NFU0 AL136231.1-201ENST00000429407 730 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BEST4Q8NFU0 LINC01372-201ENST00000430244 489 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
BEST4Q8NFU0 TRMT2B-AS1-201ENST00000443801 205 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
BEST4Q8NFU0 AC079117.1-201ENST00000445178 1000 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
BEST4Q8NFU0 AC009244.1-201ENST00000450566 258 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BEST4Q8NFU0 HIGD1AP16-201ENST00000450986 258 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BEST4Q8NFU0 SLAMF6P1-201ENST00000451067 602 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BEST4Q8NFU0 AKR1C2-203ENST00000455190 1098 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
BEST4Q8NFU0 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
BEST4Q8NFU0 AC090589.1-201ENST00000473109 362 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BEST4Q8NFU0 SEPT7P9-201ENST00000475691 413 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
BEST4Q8NFU0 RPL5P33-201ENST00000487833 905 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BEST4Q8NFU0 OR7E157P-201ENST00000494376 911 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BEST4Q8NFU0 AC009567.2-201ENST00000502989 349 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BEST4Q8NFU0 AC112184.1-201ENST00000505179 312 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BEST4Q8NFU0 OR7E99P-201ENST00000505750 922 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BEST4Q8NFU0 AC239584.1-201ENST00000510419 732 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
BEST4Q8NFU0 CCNHP1-201ENST00000513311 678 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BEST4Q8NFU0 RNU4-18P-201ENST00000516751 149 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BEST4Q8NFU0 AC015468.2-201ENST00000519605 550 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
BEST4Q8NFU0 AC109466.1-215ENST00000519750 516 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
BEST4Q8NFU0 AC110056.1-201ENST00000525759 911 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BEST4Q8NFU0 AC079600.3-201ENST00000547898 447 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
BEST4Q8NFU0 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
BEST4Q8NFU0 AC092652.2-201ENST00000552220 622 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
BEST4Q8NFU0 CHEK2P2-201ENST00000554701 672 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BEST4Q8NFU0 EIF1AXP2-201ENST00000555940 413 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BEST4Q8NFU0 AC104151.1-201ENST00000563764 323 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
BEST4Q8NFU0 AL163952.1-202ENST00000569625 600 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BEST4Q8NFU0 AC239809.3-206ENST00000596091 741 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
BEST4Q8NFU0 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
BEST4Q8NFU0 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BEST4Q8NFU0 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BEST4Q8NFU0 OXSM-209ENST00000626005 309 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
BEST4Q8NFU0 AC022167.5-202ENST00000637237 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
BEST4Q8NFU0 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
BEST4Q8NFU0 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
BEST4Q8NFU0 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
BEST4Q8NFU0 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
BEST4Q8NFU0 AC099811.1-201ENST00000597755 1496 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
BEST4Q8NFU0 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
BEST4Q8NFU0 DDX6-207ENST00000617381 2883 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
BEST4Q8NFU0 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
BEST4Q8NFU0 LGALS8-204ENST00000352231 1402 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
BEST4Q8NFU0 TET1P1-201ENST00000426627 2301 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BEST4Q8NFU0 LINC02153-202ENST00000522604 1644 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
BEST4Q8NFU0 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BEST4Q8NFU0 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
BEST4Q8NFU0 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
BEST4Q8NFU0 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
BEST4Q8NFU0 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
BEST4Q8NFU0 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
BEST4Q8NFU0 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
BEST4Q8NFU0 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
BEST4Q8NFU0 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
BEST4Q8NFU0 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
BEST4Q8NFU0 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
BEST4Q8NFU0 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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BEST4Q8NFU0 RPS7P8-201ENST00000418311 581 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BEST4Q8NFU0 AL135785.1-201ENST00000422554 399 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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BEST4Q8NFU0 GAPDHP75-201ENST00000433910 943 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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BEST4Q8NFU0 COX4I1P2-201ENST00000447446 547 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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BEST4Q8NFU0 AL929410.2-201ENST00000451170 189 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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BEST4Q8NFU0 NREP-217ENST00000509025 987 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
BEST4Q8NFU0 AC094105.1-201ENST00000509745 560 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
BEST4Q8NFU0 AC098829.1-202ENST00000513384 537 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
BEST4Q8NFU0 NREP-223ENST00000515855 801 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
BEST4Q8NFU0 FBXO16-207ENST00000518734 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
BEST4Q8NFU0 AC025366.1-201ENST00000523264 202 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
BEST4Q8NFU0 AC083973.1-201ENST00000523459 590 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
BEST4Q8NFU0 CYCSP25-201ENST00000525280 316 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BEST4Q8NFU0 AC090424.1-201ENST00000535243 736 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BEST4Q8NFU0 CLEC2B-202ENST00000538152 745 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
BEST4Q8NFU0 LRTOMT-217ENST00000539587 428 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
BEST4Q8NFU0 LINC00944-204ENST00000544499 366 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
BEST4Q8NFU0 AC127522.1-201ENST00000560531 751 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
BEST4Q8NFU0 MIR9-3HG-211ENST00000561037 779 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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