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| DUX4L9 | Q6RFH8 | AC132807.1-201 | ENST00000449613 | 458 nt | TSL 3 BASIC | 4.96 | □□□□□ -1.62 | | |
| DUX4L9 | Q6RFH8 | HRAT17-202 | ENST00000451962 | 687 nt | TSL 5 BASIC | 4.96 | □□□□□ -1.62 | | |
| DUX4L9 | Q6RFH8 | AC144530.1-201 | ENST00000452862 | 555 nt | BASIC | 4.96 | □□□□□ -1.62 | | |
| DUX4L9 | Q6RFH8 | AL355032.1-201 | ENST00000472981 | 438 nt | BASIC | 4.96 | □□□□□ -1.62 | | |
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| DUX4L9 | Q6RFH8 | AJ009632.2-208 | ENST00000635525 | 4123 nt | TSL 5 BASIC | 4.95 | □□□□□ -1.62 | | |
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| DUX4L9 | Q6RFH8 | WDR63-202 | ENST00000326813 | 2888 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 4.95 | □□□□□ -1.62 | | |
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| DUX4L9 | Q6RFH8 | MUC4-215 | ENST00000475231 | 16273 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 4.95 | □□□□□ -1.62 | | |
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| DUX4L9 | Q6RFH8 | AL161756.3-201 | ENST00000641216 | 2071 nt | BASIC | 4.95 | □□□□□ -1.62 | | |
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| DUX4L9 | Q6RFH8 | PPIAL4G-201 | ENST00000419275 | 3856 nt | APPRIS P1 BASIC | 4.95 | □□□□□ -1.62 | | |
| DUX4L9 | Q6RFH8 | AF127577.4-201 | ENST00000432230 | 5929 nt | TSL 5 BASIC | 4.95 | □□□□□ -1.62 | | |
| DUX4L9 | Q6RFH8 | PTBP3-207 | ENST00000458258 | 7995 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.94 | □□□□□ -1.62 | | |
| DUX4L9 | Q6RFH8 | ZNF101P1-201 | ENST00000435701 | 1720 nt | BASIC | 4.94 | □□□□□ -1.62 | | |