Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 LINC02495-203ENST00000636704 242 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
USF2Q15853 CNTRL-204ENST00000373847 3372 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
USF2Q15853 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AC090510.1-202ENST00000500850 2017 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
USF2Q15853 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
USF2Q15853 KIF27-202ENST00000334204 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
USF2Q15853 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
USF2Q15853 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
USF2Q15853 LNPK-212ENST00000544803 7647 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
USF2Q15853 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
USF2Q15853 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
USF2Q15853 C2CD6-201ENST00000286195 2104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
USF2Q15853 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
USF2Q15853 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
USF2Q15853 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
USF2Q15853 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
USF2Q15853 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
USF2Q15853 CASP5-201ENST00000260315 1414 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
USF2Q15853 ALG13-203ENST00000394780 4133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
USF2Q15853 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
USF2Q15853 CLEC12A-205ENST00000434319 1515 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
USF2Q15853 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
USF2Q15853 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
USF2Q15853 LZTFL1-201ENST00000296135 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
USF2Q15853 FAM183A-201ENST00000335282 488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
USF2Q15853 SEC61G-201ENST00000352861 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AC092634.1-201ENST00000366505 199 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
USF2Q15853 XAGE3-202ENST00000375491 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
USF2Q15853 RNU11-6P-201ENST00000391127 133 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AL096800.1-201ENST00000405326 893 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
USF2Q15853 FAM183A-205ENST00000410048 500 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AL513188.1-201ENST00000421167 614 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AL050344.1-201ENST00000424084 490 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AL158212.1-201ENST00000428766 315 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AL035701.1-202ENST00000437249 371 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AC079763.1-201ENST00000441295 738 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AC139712.3-201ENST00000443926 639 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AP000146.1-203ENST00000444178 309 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
USF2Q15853 OR9A1P-202ENST00000484361 945 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AC009567.2-201ENST00000502989 349 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
USF2Q15853 MGAT4D-201ENST00000503109 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AC091979.1-201ENST00000517595 706 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AC012103.1-201ENST00000522281 780 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AC007991.4-201ENST00000522970 605 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AF117829.1-205ENST00000524190 383 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
USF2Q15853 EBF2-204ENST00000535548 1017 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AC025419.1-203ENST00000540652 726 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
USF2Q15853 NELL2-211ENST00000548826 559 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
USF2Q15853 TPRX1P1-201ENST00000557620 319 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AC018845.1-201ENST00000564193 744 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
USF2Q15853 LINC02129-201ENST00000564381 692 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AC090125.1-201ENST00000581541 493 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AC090283.1-201ENST00000582101 265 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AC073046.2-201ENST00000604756 527 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
USF2Q15853 SMR3B-204ENST00000614072 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
USF2Q15853 PRL-202ENST00000615510 1268 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
USF2Q15853 MALAT1-209ENST00000616691 587 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AC069234.4-201ENST00000621276 412 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AL512356.3-201ENST00000623005 461 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AF121898.1-201ENST00000440763 1860 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AL136984.1-201ENST00000607611 1893 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AL121985.1-201ENST00000598917 1308 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
USF2Q15853 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
USF2Q15853 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
USF2Q15853 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AC125238.2-201ENST00000430003 1440 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
USF2Q15853 FANCD2P2-201ENST00000437591 1400 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
USF2Q15853 VEPH1-205ENST00000468233 1401 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
USF2Q15853 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AOX3P-204ENST00000491025 2107 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
USF2Q15853 TCP1P3-201ENST00000414406 1498 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
USF2Q15853 SMG1P5-202ENST00000529428 4219 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
USF2Q15853 SMG1P2-201ENST00000566127 4221 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
USF2Q15853 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
USF2Q15853 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
USF2Q15853 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
USF2Q15853 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
USF2Q15853 MRPL47-201ENST00000259038 1126 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
USF2Q15853 OR4K5-201ENST00000315915 1078 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
USF2Q15853 RNU1-84P-201ENST00000365447 164 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
USF2Q15853 SULT6B1-201ENST00000407963 902 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
USF2Q15853 RN7SKP221-201ENST00000410420 301 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AC006509.1-201ENST00000420788 634 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
USF2Q15853 MAGI2-AS1-201ENST00000428298 472 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AL592146.1-201ENST00000433869 1126 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
USF2Q15853 MEOX2-AS1-201ENST00000442176 697 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AL138921.1-201ENST00000444359 846 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AP000302.1-201ENST00000450928 666 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
USF2Q15853 RPS27AP3-201ENST00000453803 454 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
USF2Q15853 VPS25P1-201ENST00000455691 508 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AL022319.1-201ENST00000458183 1167 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
USF2Q15853 RPL5P33-201ENST00000487833 905 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AC114956.1-201ENST00000504277 512 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
USF2Q15853 NREP-217ENST00000509025 987 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
USF2Q15853 LINC01217-201ENST00000514427 562 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
USF2Q15853 C5orf46-203ENST00000515291 573 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
USF2Q15853 MINOS1P4-201ENST00000515470 318 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
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