Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 CBLN2-208ENST00000584764 543 ntTSL 4 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 AC012370.2-201ENST00000597541 1080 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 AC011500.1-201ENST00000601963 469 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 AC073333.2-201ENST00000603589 769 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 AL645933.2-201ENST00000606743 1207 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 AC007620.3-201ENST00000608131 497 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 AC093388.1-201ENST00000609166 430 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 MAPK10-350ENST00000641777 965 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 SELE-204ENST00000367776 3576 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 ZCCHC6-201ENST00000277141 5724 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 CDC16-202ENST00000252458 1991 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 AC022417.1-201ENST00000624768 1303 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 LINC00616-205ENST00000514600 2017 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 MTRNR2L3-201ENST00000543500 1539 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 PAPD4-203ENST00000428308 2204 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 GABRA2-205ENST00000507069 1562 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 AC099506.1-201ENST00000567359 4037 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 AL132656.3-201ENST00000606384 1595 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 OR2T29-202ENST00000641069 2637 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 OR8K1-201ENST00000279783 1087 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 RNU1-134P-201ENST00000362935 165 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 DAOA-202ENST00000375936 742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 MIR7-1-201ENST00000384871 110 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 NPM1P38-201ENST00000403835 865 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 RNASE9-202ENST00000404716 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 ZEB2-AS1-203ENST00000428623 436 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 RPSAP65-201ENST00000429660 595 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 AL392003.1-201ENST00000434394 243 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 AC114878.1-201ENST00000441166 358 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 FTLP8-201ENST00000446770 267 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 AC004994.1-201ENST00000447057 313 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 PPIAP7-201ENST00000454070 489 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 RPL31P53-201ENST00000457065 348 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 SYPL1-205ENST00000470347 1193 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 RN7SL612P-201ENST00000497704 295 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 AC112484.3-201ENST00000505910 329 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 AC093815.1-201ENST00000508637 280 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 AC010425.1-201ENST00000511734 554 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 AC117525.1-201ENST00000515228 503 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 NPM1P52-201ENST00000518264 846 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 LGALS8-217ENST00000525042 903 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 AP000620.1-201ENST00000527147 504 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 AP002370.2-201ENST00000531424 545 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 RNASE9-205ENST00000553706 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 C16orf52-205ENST00000567004 951 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 OOSP1P2-201ENST00000579644 351 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 NPM1P45-201ENST00000583151 559 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 LINC01533-204ENST00000590719 435 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 AL590410.1-201ENST00000617925 333 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 CTAGE5-201ENST00000280082 2554 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 STXBP4-203ENST00000405898 2229 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 DNM1P47-202ENST00000561463 15043 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 KYNUP3-201ENST00000574386 1341 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 RBMY1HP-201ENST00000382759 1389 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 KIAA2012-204ENST00000498697 3772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 AC120036.2-201ENST00000509729 1474 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 AC008163.1-201ENST00000636281 1455 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 HNMT-203ENST00000329366 835 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 XAGE5-201ENST00000351072 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 RNU6-386P-201ENST00000362650 107 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 RN7SKP250-201ENST00000363924 321 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 RNU6-670P-201ENST00000364312 104 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 RBMS3-AS2-201ENST00000366321 582 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 AL607077.1-201ENST00000401718 499 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 AHSA2-203ENST00000410073 479 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 MYL6P5-201ENST00000412707 459 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 AC096644.3-201ENST00000416788 338 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 RPS7P8-201ENST00000418311 581 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 AC007064.3-201ENST00000422608 359 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 RPL12P12-201ENST00000424633 501 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 FRMPD4-AS1-201ENST00000425057 285 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 AC130360.1-201ENST00000425489 1117 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 MTCO1P57-201ENST00000432182 261 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 AL583839.2-201ENST00000443716 641 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 AC044810.1-201ENST00000480271 711 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 GCSAM-204ENST00000484193 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 AP002453.1-201ENST00000492327 668 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115 ms