Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 MOCS2-205ENST00000508922 1210 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 AC010343.3-202ENST00000510327 619 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 AC010260.1-201ENST00000511484 664 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 LINCR-0001-202ENST00000518098 524 ntTSL 4 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 DPPA3P2-202ENST00000557188 1219 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 AL049874.4-201ENST00000557593 255 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 LINC00921-201ENST00000572123 243 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 AC127024.4-201ENST00000585212 308 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 CT45A1-201ENST00000594117 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 AC008555.7-201ENST00000605008 583 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 AP000904.1-201ENST00000609911 951 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 AL589745.2-201ENST00000616366 555 ntTSL 4 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 AL359094.1-202ENST00000629917 1113 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 ZNF329-201ENST00000358067 3290 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 AC084816.1-210ENST00000540895 1920 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 NAT2-201ENST00000286479 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 DPH5-203ENST00000370109 1316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 CAPRIN2-203ENST00000417045 3535 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 GABRG2-228ENST00000640985 3086 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 AMN1-208ENST00000537562 1538 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 ZNF571-202ENST00000358744 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 AC119674.1-202ENST00000641333 1860 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 AF287957.1-201ENST00000607368 1595 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 CLEC4A-203ENST00000352620 615 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 CLEC4A-204ENST00000360500 597 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 RNA5SP375-201ENST00000362975 119 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 RNA5SP350-201ENST00000363298 111 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 CRP-204ENST00000368112 787 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 AL031985.1-201ENST00000392713 418 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 RPS17P17-201ENST00000419392 409 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 AC097721.1-201ENST00000427150 1253 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 AC104843.2-201ENST00000427666 297 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 HMGN1P8-201ENST00000463578 288 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 OR2A1-AS1-202ENST00000467944 422 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 PSMA2P2-201ENST00000504319 686 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 OCIAD1-216ENST00000509122 1204 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 MTATP6P1-201ENST00000514057 681 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 LINC01217-201ENST00000514427 562 ntTSL 4 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 SNORD46.2-201ENST00000516021 102 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 RNA5SP271-201ENST00000516700 88 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 UQCRB-204ENST00000518406 595 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 AC022826.1-201ENST00000519383 805 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 AC012613.1-201ENST00000522685 387 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 PTER-205ENST00000535784 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 AC025419.1-207ENST00000546198 1072 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 FLVCR2-207ENST00000555027 938 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 LINC01146-207ENST00000557339 397 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 AC011270.1-201ENST00000558606 583 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 AP000842.3-201ENST00000564354 808 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 AC009120.4-201ENST00000564455 513 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 AC138907.7-201ENST00000568972 358 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 AC092121.1-201ENST00000569452 202 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 AC087501.3-201ENST00000576477 513 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 AC012146.2-201ENST00000576545 416 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 AC011476.3-202ENST00000586845 553 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 BNIP3P7-201ENST00000605641 516 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 Metazoa_SRP.134-201ENST00000610965 327 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 AC005899.7-201ENST00000618199 588 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 HNF1A-AS1-205ENST00000619441 343 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 AP001153.1-201ENST00000641024 338 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 OR51I2-202ENST00000641930 3302 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 CEP290-202ENST00000397838 2421 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 TEX41-210ENST00000451774 2098 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 IL21-AS1-201ENST00000417927 3748 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 GABRA2-205ENST00000507069 1562 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 AL132656.3-201ENST00000606384 1595 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 CLCC1-204ENST00000369968 4151 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 KARSP1-201ENST00000451871 1752 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 CARF-212ENST00000434998 1955 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 AL442071.1-201ENST00000289890 558 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 OR8H3-201ENST00000313472 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 HEATR1-201ENST00000366579 793 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 FAM66C-201ENST00000372173 678 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 RNU6-316P-201ENST00000391027 107 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 AL360271.1-201ENST00000395679 510 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 NPM1P10-201ENST00000398310 865 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 AL354890.1-201ENST00000413730 346 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 AC107079.1-201ENST00000416509 669 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 AL109807.1-201ENST00000438222 569 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 CFL1P4-201ENST00000451536 498 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 NCK1-AS1-201ENST00000461864 1194 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 AC078828.1-201ENST00000471993 458 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 PPP1R11P1-201ENST00000486095 376 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 AC135457.1-201ENST00000503553 664 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 KCTD21-AS1-203ENST00000527321 586 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 AC105339.2-201ENST00000558342 1091 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 AC048382.2-201ENST00000560239 492 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
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