Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 GRID2-204ENST00000510992 2739 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
TRAF1Q13077 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
TRAF1Q13077 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
TRAF1Q13077 PYROXD1-205ENST00000538582 3639 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
TRAF1Q13077 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
TRAF1Q13077 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
TRAF1Q13077 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
TRAF1Q13077 AC119674.1-202ENST00000641333 1860 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
TRAF1Q13077 AL442128.2-201ENST00000620246 1824 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
TRAF1Q13077 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
TRAF1Q13077 AC124017.1-201ENST00000508112 1594 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
TRAF1Q13077 PSG10P-201ENST00000501199 1500 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
TRAF1Q13077 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
TRAF1Q13077 ZNF28-201ENST00000339844 650 ntTSL 4 BASIC6.88□□□□□ -1.31
TRAF1Q13077 DYDC1-202ENST00000372204 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
TRAF1Q13077 AL096711.1-201ENST00000404780 554 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
TRAF1Q13077 MIR1203-201ENST00000408812 85 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
TRAF1Q13077 AL136979.1-201ENST00000421645 1120 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
TRAF1Q13077 AL445928.1-201ENST00000435545 222 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
TRAF1Q13077 RPS7P3-201ENST00000443360 580 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
TRAF1Q13077 OR2A1-AS1-202ENST00000467944 422 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
TRAF1Q13077 AC012123.2-201ENST00000485809 248 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
TRAF1Q13077 PRB1-202ENST00000500254 775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
TRAF1Q13077 PDE4D-225ENST00000515835 590 ntTSL 4 BASIC6.88□□□□□ -1.31
TRAF1Q13077 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
TRAF1Q13077 AC008429.4-201ENST00000521201 182 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
TRAF1Q13077 DPPA3P2-202ENST00000557188 1219 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
TRAF1Q13077 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
TRAF1Q13077 AC015727.1-201ENST00000572792 512 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
TRAF1Q13077 AC023389.2-201ENST00000580031 955 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
TRAF1Q13077 AC015726.1-202ENST00000602532 475 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
TRAF1Q13077 AC145423.1-201ENST00000605712 336 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
TRAF1Q13077 AC015982.1-201ENST00000608113 465 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
TRAF1Q13077 DCX-211ENST00000637570 6162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
TRAF1Q13077 NFIB-204ENST00000380953 2381 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
TRAF1Q13077 AC005480.1-202ENST00000555916 3548 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
TRAF1Q13077 TYW3-203ENST00000457880 3335 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
TRAF1Q13077 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
TRAF1Q13077 MTOR-202ENST00000376838 4017 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
TRAF1Q13077 CCDC26-201ENST00000446592 1721 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
TRAF1Q13077 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
TRAF1Q13077 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
TRAF1Q13077 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
TRAF1Q13077 LINC01450-201ENST00000443406 3263 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
TRAF1Q13077 CCNE2-202ENST00000396133 1361 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
TRAF1Q13077 MEPE-209ENST00000560249 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
TRAF1Q13077 AC004852.2-201ENST00000614289 2218 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
TRAF1Q13077 SNTN-201ENST00000343837 1090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
TRAF1Q13077 RPS24-201ENST00000360830 514 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
TRAF1Q13077 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
TRAF1Q13077 PRH2-201ENST00000381847 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
TRAF1Q13077 TRGV10-201ENST00000390341 512 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
TRAF1Q13077 SNORA11.3-201ENST00000408471 128 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
TRAF1Q13077 LIX1L-AS1-202ENST00000412239 570 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
TRAF1Q13077 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
TRAF1Q13077 AC092687.1-201ENST00000418835 389 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
TRAF1Q13077 ICA1L-210ENST00000425178 879 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
TRAF1Q13077 AC108488.1-202ENST00000439547 482 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
TRAF1Q13077 CUBNP2-201ENST00000443534 1139 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
TRAF1Q13077 CASP5-205ENST00000444749 1237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
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TRAF1Q13077 TPT1-AS1-206ENST00000519454 709 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
TRAF1Q13077 LGALS8-217ENST00000525042 903 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
TRAF1Q13077 CASP5-209ENST00000531367 879 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
TRAF1Q13077 FLVCR2-207ENST00000555027 938 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
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TRAF1Q13077 LINC01572-205ENST00000570152 360 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
TRAF1Q13077 AC119868.1-202ENST00000584741 347 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
TRAF1Q13077 AC091151.1-201ENST00000587369 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
TRAF1Q13077 TPTE2P2-202ENST00000605924 2113 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
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TRAF1Q13077 AL445670.1-201ENST00000618889 801 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
TRAF1Q13077 SNORA11.6-201ENST00000619030 128 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
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TRAF1Q13077 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
TRAF1Q13077 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
TRAF1Q13077 ZNF177-202ENST00000589262 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
TRAF1Q13077 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
TRAF1Q13077 FCHSD2-201ENST00000311172 4340 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
TRAF1Q13077 FAM197Y8-201ENST00000426661 2340 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
TRAF1Q13077 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
TRAF1Q13077 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
TRAF1Q13077 DBT-201ENST00000370131 1521 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
TRAF1Q13077 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
TRAF1Q13077 PDZK1P1-202ENST00000425209 1350 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
TRAF1Q13077 AC114876.1-201ENST00000490962 1366 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
TRAF1Q13077 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
TRAF1Q13077 TRPC4-201ENST00000338947 2912 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
TRAF1Q13077 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
TRAF1Q13077 AL360271.1-201ENST00000395679 510 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
TRAF1Q13077 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
TRAF1Q13077 AL391704.3-201ENST00000425365 831 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
TRAF1Q13077 CDY8P-201ENST00000428380 1279 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
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