Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 LINC02119-201ENST00000508853 2573 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 DDX47-201ENST00000352940 1698 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AC096992.2-201ENST00000609553 1684 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 ATP5BP1-201ENST00000411980 1574 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 TXNRD1-203ENST00000397736 3832 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 OAS2-201ENST00000342315 3613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC6.21□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 C4orf17-201ENST00000326581 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AL589826.1-201ENST00000340697 249 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 TRGV11-201ENST00000390340 463 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 CLEC7A-206ENST00000396484 1000 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 HIBCH-207ENST00000410045 854 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 RN7SKP188-201ENST00000410789 317 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AL157932.1-201ENST00000413246 363 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 RPL23AP18-201ENST00000416139 468 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 ACAP2-IT1-201ENST00000419899 690 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AL590609.2-201ENST00000421430 368 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 ETDB-201ENST00000423661 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 ETDB-202ENST00000426364 388 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 ETDA-201ENST00000427686 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AC006333.1-204ENST00000429396 648 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 LINC02522-201ENST00000431401 256 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 FGF13-AS1-201ENST00000438238 849 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 DARS-AS1-206ENST00000446492 488 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 LINC01831-201ENST00000449772 493 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 LINC01795-201ENST00000454367 813 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 ETDA-202ENST00000454551 388 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AP002345.1-201ENST00000456493 928 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AL603882.1-201ENST00000463059 681 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 RN7SL393P-201ENST00000463588 296 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 RN7SL515P-201ENST00000463999 297 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AC022415.1-202ENST00000486612 523 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 RN7SL170P-201ENST00000487098 295 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 LINC00903-201ENST00000497854 223 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 NREP-217ENST00000509025 987 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AC108471.1-201ENST00000513977 287 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 NREP-223ENST00000515855 801 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 CARSP2-201ENST00000520688 277 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AC009563.1-202ENST00000523365 643 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AC090193.1-202ENST00000524355 566 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AC022874.1-201ENST00000526382 550 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AC073172.2-201ENST00000527770 571 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AL590385.2-201ENST00000537821 553 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AP000593.3-201ENST00000546065 578 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AC007333.2-201ENST00000569998 559 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AC004232.1-201ENST00000571388 208 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 RN7SL753P-201ENST00000581238 290 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AC007448.1-201ENST00000582714 234 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 WDR45BP1-201ENST00000583470 1029 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AC009303.2-201ENST00000585381 1083 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AC022916.2-201ENST00000590144 559 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AC092032.1-201ENST00000603090 165 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AL359704.2-201ENST00000604335 521 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AL445647.2-201ENST00000615170 130 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 PPP3CB-AS1-215ENST00000620559 656 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 FP236315.3-201ENST00000623587 307 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AL513283.1-203ENST00000640010 891 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AL163152.1-201ENST00000642001 374 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AL512329.1-201ENST00000404600 1592 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AL138828.1-203ENST00000419926 1570 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 ZNF679-202ENST00000421025 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 DDX18P3-201ENST00000404856 2007 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 C16orf62-204ENST00000448695 3353 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 CASP5-208ENST00000526056 1344 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 GYPA-214ENST00000641688 1764 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 DDAH1-204ENST00000535924 3909 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 GOLGB1-202ENST00000393667 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 ELMOD2-201ENST00000323570 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 TOP2B-201ENST00000264331 5358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AL354733.2-209ENST00000589233 1434 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AL359715.4-201ENST00000606629 1436 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 MAGI2-235ENST00000637282 3174 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 PCYT1B-201ENST00000356768 1289 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 RNA5SP188-201ENST00000362916 129 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 MIR421-201ENST00000365696 85 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 RNU6-152P-201ENST00000384037 107 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 RNU4-31P-201ENST00000384211 141 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 RNU6-532P-201ENST00000384318 107 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 RNA5SP53-201ENST00000391299 120 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 CHMP1B2P-201ENST00000399581 597 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 RN7SKP268-201ENST00000411107 316 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 RNA5SP280-201ENST00000411230 115 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
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