Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 ZNF528-201ENST00000360465 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 CUZD1-205ENST00000368904 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 ZNF26-202ENST00000534834 4853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AC124017.1-201ENST00000508112 1594 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 PCYT1A-204ENST00000419333 1325 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 LUZP2-201ENST00000336930 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 RMDN2-201ENST00000234195 1985 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 PPP1R1C-201ENST00000280295 1636 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-618P-201ENST00000363518 112 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 RNU1-84P-201ENST00000365447 164 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AL591503.1-201ENST00000366224 477 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 RSPO3-202ENST00000368317 1290 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 MYO3A-202ENST00000376301 727 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 MIR433-201ENST00000384837 93 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 TEX50-201ENST00000417563 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 SMARCE1P1-201ENST00000417747 1186 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 LINC01393-201ENST00000419905 746 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AL590432.1-201ENST00000420071 566 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AL135785.1-201ENST00000422554 399 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AC083862.1-201ENST00000427378 1242 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AL512637.2-201ENST00000431287 1256 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AL392003.1-201ENST00000434394 243 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AL645939.3-201ENST00000435408 225 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 FBXW12-203ENST00000436231 1117 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 NPM1P23-201ENST00000440193 849 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 HMGN1P32-201ENST00000441744 256 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AC139712.3-201ENST00000443926 639 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 NPM1P9-201ENST00000453156 844 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 C1DP3-201ENST00000455013 423 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 CTSLP6-201ENST00000458273 1002 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL221P-201ENST00000466190 281 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AC108941.2-201ENST00000506796 716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AC093325.1-201ENST00000508378 326 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 LINC01217-201ENST00000514427 562 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP400-201ENST00000517155 111 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 CHCHD7-210ENST00000521524 703 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 OR9G2P-201ENST00000533326 880 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AC007207.2-201ENST00000543206 542 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AC011611.4-201ENST00000547721 779 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AL357153.3-201ENST00000553982 611 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AL139354.1-201ENST00000554319 645 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AC105243.1-201ENST00000563172 1165 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 ARPP19-204ENST00000563277 955 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AC005632.2-201ENST00000564271 828 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AC036176.3-201ENST00000602456 418 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 MTATP6P2-201ENST00000603319 678 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AL591222.2-201ENST00000604443 754 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-84P-201ENST00000607737 102 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AC095038.2-201ENST00000621464 1070 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 LINC00216-201ENST00000623548 1126 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AC138907.10-201ENST00000623708 983 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 RBMS3-AS3-202ENST00000635847 738 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 SPTY2D1-AS1-206ENST00000636011 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 CCDC129-211ENST00000615280 4142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 SLC16A4-201ENST00000369779 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 LGALSL-202ENST00000409537 3298 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 NBPF9-203ENST00000610300 2930 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 RNF217-202ENST00000368414 1771 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 ZNF610-202ENST00000327920 1855 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AF121898.1-201ENST00000440763 1860 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 VEPH1-205ENST00000468233 1401 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 ZC3H7A-214ENST00000575984 2632 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 UGT2B11-201ENST00000446444 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AC110792.3-201ENST00000595906 1614 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 BEND2-201ENST00000380030 1938 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 RPS29-201ENST00000245458 296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 OR4K5-201ENST00000315915 1078 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 RNU11-6P-201ENST00000391127 133 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AL356057.1-202ENST00000402263 756 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 MIR1266-201ENST00000408125 84 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 METTL5-205ENST00000409837 936 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AC017048.1-201ENST00000412153 495 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 MTCO2P8-201ENST00000412213 658 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AL359885.1-201ENST00000415786 903 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 NAALADL2-AS2-201ENST00000424690 1038 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 RAB9AP5-201ENST00000437794 597 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 RAB9AP2-201ENST00000443911 597 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AL160408.1-203ENST00000453568 631 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AL390783.1-203ENST00000457058 248 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL790P-201ENST00000474043 298 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 LARP7P4-201ENST00000481075 878 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AC005017.1-201ENST00000482002 490 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL714P-201ENST00000487050 298 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AOX3P-204ENST00000491025 2107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
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