Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 VTA1P1-201ENST00000414044 866 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 RPA2P2-201ENST00000419698 796 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC7.07□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 ZEB1-AS1-202ENST00000424191 320 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 DLEU1-AS1-201ENST00000428276 731 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 AC002486.2-201ENST00000447806 590 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 TDRG1-202ENST00000448433 1015 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 RBBP6-204ENST00000452655 854 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 RN7SL414P-201ENST00000469545 294 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 TMED11P-201ENST00000479478 690 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 AF186996.3-201ENST00000509527 964 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 NREP-223ENST00000515855 801 ntTSL 4 BASIC7.07□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 OPRM1-223ENST00000524163 1251 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 AC103681.2-201ENST00000527450 567 ntTSL 4 BASIC7.07□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 OR7E87P-201ENST00000532397 929 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 AC078950.1-201ENST00000538349 550 ntTSL 4 BASIC7.07□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 AC119044.1-202ENST00000548463 339 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 AC073571.1-201ENST00000549103 475 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 NUTF2P2-201ENST00000551207 384 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 AC105275.2-201ENST00000567907 711 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 AC007495.1-203ENST00000569025 888 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 AP005202.2-201ENST00000582386 658 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 AC005537.1-201ENST00000588324 1238 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 AL137072.1-201ENST00000603444 466 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 IMMP1LP1-201ENST00000605170 488 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 AL109918.2-201ENST00000605188 279 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 U47924.1-201ENST00000606539 434 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 MIR6736-201ENST00000616799 59 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 SPINK6-203ENST00000621437 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 SNORA43.5-201ENST00000631270 138 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 AC233280.20-201ENST00000637412 416 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 RPL36AP21-202ENST00000639134 430 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 MEF2C-201ENST00000340208 6192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 NOX1-204ENST00000372966 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 BRDT-202ENST00000362005 3409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 ADAM7-203ENST00000441335 1417 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 AP002364.1-201ENST00000623330 3386 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 IL1RAP-202ENST00000317757 5413 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 LIN9-205ENST00000481685 1916 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 COX7C-203ENST00000509578 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 UTY-212ENST00000545955 6817 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 PAK5-201ENST00000353224 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 BDNF-209ENST00000420794 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 CCL28-201ENST00000361115 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 CCNC-204ENST00000482541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 SIPA1L1-201ENST00000358550 6539 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 MUC4-209ENST00000463781 17110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 CPS1-201ENST00000233072 5821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 LINC00907-201ENST00000585627 3324 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 LEPR-203ENST00000371058 2805 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 CDY1-201ENST00000306609 2321 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 CDY1B-201ENST00000306882 2321 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 USP16-204ENST00000399976 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 NUP93-202ENST00000542526 8257 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 E2F8-201ENST00000250024 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 SENP1-201ENST00000448372 4679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 GPRIN3-201ENST00000333209 6260 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 ACSL5-201ENST00000354273 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 METTL21EP-201ENST00000298105 713 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 OR2T10-201ENST00000330500 1049 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 RN7SKP174-201ENST00000363803 330 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 COQ3-202ENST00000369240 646 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 FCGR1B-202ENST00000369383 570 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 TMEM225-201ENST00000375026 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 RNU4-31P-201ENST00000384211 141 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 KCNAB1-202ENST00000389634 1119 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 AC092952.1-201ENST00000397646 1209 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 MTCO3P31-201ENST00000405526 789 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 ATG4AP1-201ENST00000416893 538 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 LINC02020-202ENST00000421006 575 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 RPL23AP34-201ENST00000423483 410 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 HRH4-202ENST00000426880 909 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 MIR181A1HG-202ENST00000432296 930 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 AC114755.4-201ENST00000439114 443 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 LYSMD1-202ENST00000440902 1003 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 TRMT2B-AS1-201ENST00000443801 205 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 AC074257.1-201ENST00000446340 585 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 LINC00704-203ENST00000449712 703 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 AC092687.2-201ENST00000452909 568 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 AC007000.1-201ENST00000453064 794 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 MRPS21P1-201ENST00000453850 223 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 ANK3-207ENST00000460468 677 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 AC115223.1-201ENST00000466377 870 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 AC026254.1-201ENST00000479473 431 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 PFN2-217ENST00000498307 556 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.9 ms