Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 AC006600.2-201ENST00000624834 2506 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 AP002001.1-201ENST00000526101 1759 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 AP000432.2-201ENST00000624164 2048 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 AC099506.1-201ENST00000567359 4037 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 FBXL21-201ENST00000297158 1305 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 BLM-201ENST00000355112 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 ALG11-202ENST00000521508 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 TAS2R16-201ENST00000249284 997 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 TYRP1-201ENST00000381136 872 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 SNX24-202ENST00000395451 1050 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 RNU6-233P-201ENST00000410845 141 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 RN7SKP279-201ENST00000411383 298 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 MAJIN-202ENST00000432175 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 KATNBL1P2-201ENST00000433311 835 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 HNRNPA1P18-201ENST00000433537 927 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 LINC00383-201ENST00000433664 817 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 C1orf140-201ENST00000434398 645 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 AC110602.1-201ENST00000437414 318 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 AL136988.2-201ENST00000440729 861 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 AC004129.2-201ENST00000457229 287 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 CBX1-205ENST00000495350 550 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 ST13P12-201ENST00000508958 1094 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 AP003396.4-201ENST00000527574 265 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 OTX2-203ENST00000554559 715 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 AC009087.1-201ENST00000561827 369 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 AC087501.3-201ENST00000576477 513 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 LINC01906-201ENST00000582962 499 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 AC092070.2-201ENST00000597550 545 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 MIR6793-201ENST00000612376 63 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 AL138960.1-201ENST00000613838 513 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 MIR6778-201ENST00000617912 73 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 AL137789.1-204ENST00000623503 666 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 AC069542.2-201ENST00000624816 216 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 OR11H2-202ENST00000641517 1085 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 TBC1D15-201ENST00000319106 2159 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 LYARP1-201ENST00000436977 1501 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 HMMR-204ENST00000432118 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
CCSER1Q9C0I3 AC007159.1-201ENST00000566529 4706 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CCSER1Q9C0I3 ZNF24-201ENST00000261332 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCSER1Q9C0I3 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CCSER1Q9C0I3 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CCSER1Q9C0I3 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCSER1Q9C0I3 MAGI2-222ENST00000636039 5671 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCSER1Q9C0I3 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCSER1Q9C0I3 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCSER1Q9C0I3 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCSER1Q9C0I3 AC123769.1-201ENST00000530992 3192 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CCSER1Q9C0I3 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCSER1Q9C0I3 FIGN-202ENST00000409634 746 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCSER1Q9C0I3 BX284632.2-201ENST00000421091 399 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CCSER1Q9C0I3 FTO-202ENST00000431610 707 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCSER1Q9C0I3 GAPDHP34-201ENST00000432112 823 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CCSER1Q9C0I3 AC015983.1-201ENST00000441577 373 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CCSER1Q9C0I3 AL512605.1-202ENST00000441919 381 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CCSER1Q9C0I3 HMGN1P2-201ENST00000445197 310 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CCSER1Q9C0I3 AL359955.2-201ENST00000445380 353 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CCSER1Q9C0I3 AC117386.1-201ENST00000474444 606 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCSER1Q9C0I3 PPP1R11P1-201ENST00000486095 376 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CCSER1Q9C0I3 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCSER1Q9C0I3 LINC02392-201ENST00000548172 537 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCSER1Q9C0I3 AL356801.1-201ENST00000559320 294 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CCSER1Q9C0I3 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CCSER1Q9C0I3 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CCSER1Q9C0I3 AC003991.1-201ENST00000594469 484 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCSER1Q9C0I3 AL138900.3-201ENST00000607010 629 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCSER1Q9C0I3 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CCSER1Q9C0I3 AC093388.1-201ENST00000609166 430 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CCSER1Q9C0I3 Metazoa_SRP.70-201ENST00000612622 273 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CCSER1Q9C0I3 AL352984.2-202ENST00000613699 155 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CCSER1Q9C0I3 MAPKBP1-217ENST00000627631 210 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCSER1Q9C0I3 FLG-201ENST00000368799 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCSER1Q9C0I3 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCSER1Q9C0I3 RMDN2-201ENST00000234195 1985 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCSER1Q9C0I3 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCSER1Q9C0I3 C17orf78-203ENST00000611038 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCSER1Q9C0I3 SELE-204ENST00000367776 3576 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCSER1Q9C0I3 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCSER1Q9C0I3 ANGPTL5-201ENST00000334289 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCSER1Q9C0I3 MATR3-215ENST00000510056 3040 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCSER1Q9C0I3 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
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