Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 RAB30-214ENST00000534141 3746 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
ZNF548Q8NEK5 SDAD1-201ENST00000356260 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
ZNF548Q8NEK5 AC016907.2-203ENST00000455424 3563 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
ZNF548Q8NEK5 IL23R-201ENST00000347310 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
ZNF548Q8NEK5 ZEB2-244ENST00000638007 9140 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
ZNF548Q8NEK5 AC092378.1-202ENST00000500117 2296 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
ZNF548Q8NEK5 CNOT1-202ENST00000441024 4999 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
ZNF548Q8NEK5 FCHSD2-201ENST00000311172 4340 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
ZNF548Q8NEK5 LARP7-210ENST00000509061 2332 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
ZNF548Q8NEK5 PSG7-206ENST00000623675 1392 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
ZNF548Q8NEK5 LINC02010-202ENST00000471638 1829 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
ZNF548Q8NEK5 CCDC26-201ENST00000446592 1721 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
ZNF548Q8NEK5 CFAP97-201ENST00000296775 903 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ZNF548Q8NEK5 BCL2A1-202ENST00000335661 809 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ZNF548Q8NEK5 PAGE2-202ENST00000374968 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
ZNF548Q8NEK5 GABARAPL3-201ENST00000412799 354 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ZNF548Q8NEK5 AC063965.1-201ENST00000416679 499 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ZNF548Q8NEK5 AC104843.2-201ENST00000427666 297 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ZNF548Q8NEK5 AC137630.2-202ENST00000429681 555 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ZNF548Q8NEK5 C1orf140-201ENST00000434398 645 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ZNF548Q8NEK5 HTR5BP-202ENST00000434708 1193 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
ZNF548Q8NEK5 AL357507.1-201ENST00000435946 669 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
ZNF548Q8NEK5 GK-IT1-201ENST00000441146 397 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ZNF548Q8NEK5 AL365204.2-201ENST00000446754 687 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ZNF548Q8NEK5 CFL1P4-201ENST00000451536 498 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ZNF548Q8NEK5 AC103563.5-201ENST00000455643 364 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ZNF548Q8NEK5 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ZNF548Q8NEK5 AC008443.2-201ENST00000499096 566 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ZNF548Q8NEK5 HAUS1P1-201ENST00000505275 832 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ZNF548Q8NEK5 AC108941.2-201ENST00000506796 716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ZNF548Q8NEK5 LINC02196-201ENST00000512838 568 ntTSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ZNF548Q8NEK5 UQCRB-204ENST00000518406 595 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ZNF548Q8NEK5 EIF5AL1-201ENST00000520547 3840 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ZNF548Q8NEK5 AC103853.1-201ENST00000520588 649 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ZNF548Q8NEK5 OR4R2P-201ENST00000530815 597 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ZNF548Q8NEK5 VEPH1-219ENST00000537559 992 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ZNF548Q8NEK5 CLEC2B-202ENST00000538152 745 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ZNF548Q8NEK5 OLR1-210ENST00000544577 924 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ZNF548Q8NEK5 LINC02307-201ENST00000553827 257 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ZNF548Q8NEK5 AC087501.3-201ENST00000576477 513 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ZNF548Q8NEK5 AC007639.1-201ENST00000577281 833 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ZNF548Q8NEK5 AC005703.3-201ENST00000579159 373 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ZNF548Q8NEK5 MIR3614-201ENST00000581261 86 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ZNF548Q8NEK5 AC009303.3-201ENST00000591103 736 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ZNF548Q8NEK5 LINC01999-201ENST00000592917 646 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ZNF548Q8NEK5 BNIP3P27-201ENST00000599991 412 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ZNF548Q8NEK5 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ZNF548Q8NEK5 AC027243.2-201ENST00000602530 724 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ZNF548Q8NEK5 RXFP1-211ENST00000613319 3771 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
ZNF548Q8NEK5 GABRA3-204ENST00000535043 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
ZNF548Q8NEK5 KLHL2-210ENST00000538127 2907 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
ZNF548Q8NEK5 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
ZNF548Q8NEK5 MAPK10-366ENST00000641903 2812 ntAPPRIS ALT1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ZNF548Q8NEK5 AC124017.1-201ENST00000508112 1594 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ZNF548Q8NEK5 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
ZNF548Q8NEK5 ADGRL2-202ENST00000359929 4674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
ZNF548Q8NEK5 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 MSL2-202ENST00000434835 2272 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 CNTRL-204ENST00000373847 3372 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 ELOC-201ENST00000284811 683 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 OR4D5-201ENST00000307033 1095 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 HEATR1-201ENST00000366579 793 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 CAV1-204ENST00000393470 598 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 GTF3AP1-201ENST00000416942 1004 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 MTND4P11-201ENST00000417020 1058 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
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ZNF548Q8NEK5 CDY8P-201ENST00000428380 1279 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 RPL17P35-201ENST00000432217 549 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 AC242426.1-201ENST00000435270 960 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
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ZNF548Q8NEK5 LINC01851-201ENST00000443419 637 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
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ZNF548Q8NEK5 CDY20P-201ENST00000447528 1279 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 AC079896.1-201ENST00000455845 488 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 RANP2-201ENST00000456833 229 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 MTND6P32-201ENST00000457611 483 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 LINC01214-201ENST00000471222 335 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 LINC02505-203ENST00000515128 756 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 RNU6-415P-201ENST00000516252 97 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP434-201ENST00000516647 121 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 AC021733.2-201ENST00000518830 497 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 AC103726.2-201ENST00000523318 411 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 MS4A6A-210ENST00000529054 1160 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 AP000873.2-204ENST00000530825 375 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 AC092490.1-202ENST00000540299 809 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 AP000763.3-201ENST00000542598 334 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 OTX2-203ENST00000554559 715 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 FLVCR2-207ENST00000555027 938 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 RPA2P1-201ENST00000556557 721 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 AC048382.2-201ENST00000560239 492 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 AC007494.1-201ENST00000562293 760 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
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