Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 AL049634.1-201ENST00000453770 1720 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 PTPRB-210ENST00000551525 5291 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 KCNQ3-205ENST00000621976 10659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 CRYGS-201ENST00000307944 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 RN7SKP78-201ENST00000364711 318 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 LYPLA1P3-201ENST00000402650 695 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 MIR1203-201ENST00000408812 85 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 FO393401.1-203ENST00000416260 486 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 DCN-203ENST00000420120 753 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 UBE2L5P-201ENST00000436446 465 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 AL138899.2-201ENST00000439139 499 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 DCN-205ENST00000441303 519 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 DCN-206ENST00000456569 228 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 ACA64.1-201ENST00000459171 127 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 AC079080.1-201ENST00000479841 822 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 SELENOT-204ENST00000480740 783 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 AC111000.5-201ENST00000506559 1178 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 snoU109.5-201ENST00000516231 132 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 AC060775.1-201ENST00000518241 520 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 OR9A4-201ENST00000548136 1093 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 DPPA3P2-201ENST00000553589 478 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 U95743.1-201ENST00000573369 1001 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 AC130371.1-201ENST00000577023 230 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 AC091151.1-201ENST00000587369 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 AL137789.1-204ENST00000623503 666 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 CABS1-201ENST00000273936 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 PDZK1P1-202ENST00000425209 1350 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 AC021092.1-201ENST00000592946 3199 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 ST7-203ENST00000393443 2360 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 AP002478.1-201ENST00000577848 1455 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 LINC02183-201ENST00000637822 1732 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 OR8G5-203ENST00000641992 1560 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 MSR1-204ENST00000381998 2826 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 NUMB-201ENST00000355058 3342 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 MECOM-209ENST00000472280 3593 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 LRRC37A3-204ENST00000400877 3273 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 ZNF571-202ENST00000358744 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 SCGB3A2-201ENST00000296694 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 OR7E25P-201ENST00000344844 931 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 OR52B6-201ENST00000345043 1008 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 RPS24-201ENST00000360830 514 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 C1orf194-202ENST00000369945 534 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 STMN1-202ENST00000374291 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 LINC00701-201ENST00000418295 742 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 CDY8P-201ENST00000428380 1279 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 DEFA9P-201ENST00000433042 285 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 CDY20P-201ENST00000447528 1279 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 NDUFA5P5-201ENST00000468361 342 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 ST20-201ENST00000478497 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 AC006539.1-201ENST00000481419 501 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 AC099521.1-201ENST00000482557 334 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 SCGB3A2-202ENST00000504320 440 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 GLYATL1P2-201ENST00000529451 510 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 MITF-217ENST00000531774 1074 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 OTX2-203ENST00000554559 715 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 C15orf41-204ENST00000562877 764 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 AP001011.1-201ENST00000583546 690 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 AL136084.2-212ENST00000589976 654 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 SETSIP-202ENST00000596516 909 ntAPPRIS P2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 RPL12P48-201ENST00000605620 304 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 AC108865.2-201ENST00000606881 432 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 RBMS3-AS2-206ENST00000629296 438 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 OR10A6-203ENST00000641238 6052 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 PKIB-207ENST00000392491 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 SDAD1-201ENST00000356260 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 CLEC12B-202ENST00000396502 3029 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 SLC4A10-204ENST00000421911 3398 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 AC068389.1-202ENST00000526470 3564 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 PEAK1-202ENST00000558305 4644 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 MAPK9-213ENST00000539014 1668 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 AC004690.2-201ENST00000472838 1754 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 OR4G1P-202ENST00000641173 1788 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 ESRRG-208ENST00000391890 5542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms