Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 ERCC6L-202ENST00000373657 4344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 NHS-202ENST00000398097 8213 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 NABP1-204ENST00000410026 11521 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 CD209-203ENST00000315599 4283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 FAM161A-202ENST00000404929 3762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 TTLL5-217ENST00000556893 3071 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 RALYL-204ENST00000518566 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 PLCE1-203ENST00000371385 6500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AL080312.1-201ENST00000256654 824 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 ITGB3BP-201ENST00000271002 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 ANKRD36P1-201ENST00000344424 659 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 OR10A3-201ENST00000360759 1061 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 OR13C3-201ENST00000374781 1108 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AC019178.1-201ENST00000392337 440 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AC090114.1-201ENST00000393266 448 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 FAUP2-201ENST00000394301 401 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 RN7SKP148-201ENST00000410179 275 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AC096537.2-201ENST00000413707 714 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AL157698.1-201ENST00000415190 1011 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 RPL23AP85-201ENST00000421838 433 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 GPN3P1-201ENST00000423883 535 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 LINC00266-4P-201ENST00000427373 842 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AF274573.1-201ENST00000430535 494 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 LINC00390-201ENST00000432331 340 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AL122019.1-201ENST00000438575 798 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 HSFY3P-201ENST00000444242 1191 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 HMGB3P6-201ENST00000444896 598 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 MYO5BP2-201ENST00000449815 1277 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AC093157.1-204ENST00000454721 753 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AC004692.1-201ENST00000455430 424 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AC016822.1-201ENST00000457975 439 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 LSAMP-AS1-201ENST00000490351 553 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AC105924.1-201ENST00000504057 339 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AC111000.2-201ENST00000507775 550 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 C4orf19-203ENST00000508175 828 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 OXR1-212ENST00000521592 993 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 LINC01493-201ENST00000530102 460 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 C3orf14-207ENST00000542214 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 NXPE2P1-201ENST00000543705 726 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AL049844.1-201ENST00000545614 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 TGFB3-AS1-201ENST00000553732 580 ntTSL 4 BASIC7.01□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 GNG2-208ENST00000554875 430 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AC090971.3-201ENST00000557871 1041 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 PPIAP14-201ENST00000577627 496 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AC006270.1-201ENST00000582889 478 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AC009303.2-206ENST00000588042 786 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 TTN-AS1-232ENST00000589487 1077 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AP002906.1-201ENST00000603405 233 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AL445423.1-201ENST00000609941 536 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AP005212.3-201ENST00000619964 528 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 PPP3CB-AS1-215ENST00000620559 656 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AC067852.7-201ENST00000623270 535 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AC073530.2-201ENST00000623987 261 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AL160396.1-201ENST00000637433 575 ntTSL 4 BASIC7.01□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AC103706.2-201ENST00000638080 240 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 OR13C3-202ENST00000641090 1108 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 NFIA-201ENST00000357977 3200 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 PRDM2-202ENST00000311066 7437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 ZNF402P-201ENST00000404435 3100 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 ZNF227-201ENST00000313040 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 LINC02249-202ENST00000562624 4260 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 RTL9-203ENST00000540313 5225 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 MAP3K7CL-209ENST00000399947 2003 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 CCDC186-203ENST00000369287 7245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 TDRD1-201ENST00000251864 4510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 ADGRE1-203ENST00000381404 3056 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 PAIP1-202ENST00000338972 1814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 FAM240A-201ENST00000444264 1826 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 FAM240A-202ENST00000640551 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 DTNA-207ENST00000444659 6343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 OR52N5-202ENST00000641181 2778 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 LINC00702-203ENST00000608792 6300 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AC137056.2-201ENST00000624055 1958 ntBASIC7□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 DCC-203ENST00000442544 10206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 CMAHP-202ENST00000377993 1681 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 UGT2A2-202ENST00000604629 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 C17orf78-203ENST00000611038 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 HSDL2-201ENST00000398803 2983 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 LINC02523-201ENST00000423208 2963 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 PUM2-201ENST00000319801 6002 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 CSDE1-203ENST00000358528 4076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 ARPP19-211ENST00000568196 1489 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AP002478.1-201ENST00000577848 1455 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 HTR2A-202ENST00000542664 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 OR8A1-201ENST00000284287 1146 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 NPM1-202ENST00000351986 1237 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 RNA5SP65-201ENST00000363166 119 ntBASIC7□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 RNU4-81P-201ENST00000363561 144 ntBASIC7□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 RNA5SP512-201ENST00000364550 120 ntBASIC7□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 SNORA70.5-201ENST00000365519 135 ntBASIC7□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 S100A5-202ENST00000368718 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 SERPINB12-202ENST00000382768 1278 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 RNU6-316P-201ENST00000391027 107 ntBASIC7□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC7□□□□□ -1.29
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