Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SP6Q3SY56 AL021918.2-201ENST00000613415 194 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SP6Q3SY56 AC097641.3-201ENST00000613523 464 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SP6Q3SY56 Metazoa_SRP.77-201ENST00000616915 252 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SP6Q3SY56 AL161912.4-201ENST00000623889 2468 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SP6Q3SY56 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SP6Q3SY56 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SP6Q3SY56 SMARCE1-208ENST00000474246 2124 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SP6Q3SY56 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SP6Q3SY56 SNW1-204ENST00000554775 1687 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SP6Q3SY56 MTCO1P28-201ENST00000574177 1528 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SP6Q3SY56 DST-220ENST00000518935 3547 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SP6Q3SY56 LINC01204-202ENST00000435394 2214 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SP6Q3SY56 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SP6Q3SY56 CPA3-201ENST00000296046 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SP6Q3SY56 SLC38A1-211ENST00000612161 1607 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SP6Q3SY56 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SP6Q3SY56 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SP6Q3SY56 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SP6Q3SY56 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SP6Q3SY56 NRG3-208ENST00000556918 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SP6Q3SY56 XKRY2-202ENST00000623874 1581 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SP6Q3SY56 XKRY-202ENST00000624960 1581 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SP6Q3SY56 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SP6Q3SY56 CLEC4A-204ENST00000360500 597 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SP6Q3SY56 RNA5SP110-201ENST00000362638 115 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SP6Q3SY56 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SP6Q3SY56 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SP6Q3SY56 IGHV6-1-201ENST00000390593 415 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SP6Q3SY56 BTBD9-203ENST00000403056 1155 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SP6Q3SY56 NPM1P37-201ENST00000403105 874 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SP6Q3SY56 PRELID1P1-201ENST00000403549 660 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SP6Q3SY56 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SP6Q3SY56 AL512622.1-201ENST00000414106 481 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SP6Q3SY56 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SP6Q3SY56 AF064858.3-201ENST00000419664 509 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SP6Q3SY56 RPL7AP14-201ENST00000424041 802 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SP6Q3SY56 AL031681.1-201ENST00000443304 400 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SP6Q3SY56 AC007655.1-201ENST00000444324 357 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SP6Q3SY56 AC079760.2-201ENST00000449361 681 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SP6Q3SY56 AP003385.3-201ENST00000472498 287 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SP6Q3SY56 RPS7P11-201ENST00000484240 586 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SP6Q3SY56 RAB7A-205ENST00000485280 507 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SP6Q3SY56 RPS7P6-201ENST00000485777 579 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SP6Q3SY56 AC117500.1-201ENST00000497352 755 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SP6Q3SY56 LINC01484-201ENST00000517733 555 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SP6Q3SY56 OR4A43P-201ENST00000532938 908 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SP6Q3SY56 AC036111.2-201ENST00000533247 901 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SP6Q3SY56 AC024224.2-201ENST00000544225 782 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SP6Q3SY56 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SP6Q3SY56 AC026462.3-201ENST00000565153 557 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SP6Q3SY56 AC007923.1-201ENST00000577970 505 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SP6Q3SY56 AC114488.2-207ENST00000585660 700 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SP6Q3SY56 LINC01999-201ENST00000592917 646 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SP6Q3SY56 AC011478.1-201ENST00000593140 554 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SP6Q3SY56 AL512430.4-201ENST00000603085 613 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SP6Q3SY56 FP236241.1-206ENST00000625005 987 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SP6Q3SY56 SPTY2D1-AS1-206ENST00000636011 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SP6Q3SY56 OR11H2-202ENST00000641517 1085 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SP6Q3SY56 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SP6Q3SY56 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SP6Q3SY56 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SP6Q3SY56 ZNF215-205ENST00000529903 1396 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SP6Q3SY56 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SP6Q3SY56 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SP6Q3SY56 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SP6Q3SY56 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SP6Q3SY56 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SP6Q3SY56 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SP6Q3SY56 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SP6Q3SY56 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SP6Q3SY56 ZNF480-204ENST00000490272 2238 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SP6Q3SY56 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SP6Q3SY56 INSIG2-208ENST00000614681 1347 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SP6Q3SY56 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SP6Q3SY56 RRM1-201ENST00000300738 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SP6Q3SY56 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SP6Q3SY56 GRXCR2-201ENST00000377976 2002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SP6Q3SY56 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SP6Q3SY56 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SP6Q3SY56 C5orf63-201ENST00000296662 966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SP6Q3SY56 SNTN-201ENST00000343837 1090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SP6Q3SY56 RN7SKP77-201ENST00000363261 353 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SP6Q3SY56 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SP6Q3SY56 IGLV3-16-201ENST00000390311 385 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SP6Q3SY56 TRAV8-4-201ENST00000390438 469 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SP6Q3SY56 NPM1P38-201ENST00000403835 865 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SP6Q3SY56 EMX2OS-201ENST00000412075 1025 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SP6Q3SY56 LINC02246-202ENST00000418954 717 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SP6Q3SY56 SETP9-201ENST00000423837 832 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SP6Q3SY56 AL669841.1-201ENST00000425723 558 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SP6Q3SY56 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SP6Q3SY56 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SP6Q3SY56 AC092601.1-201ENST00000444526 383 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SP6Q3SY56 AC234771.2-201ENST00000445718 597 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SP6Q3SY56 BBOF1-202ENST00000463558 550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SP6Q3SY56 AL157777.1-201ENST00000468100 304 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SP6Q3SY56 RN7SL267P-201ENST00000485107 261 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SP6Q3SY56 AC131094.1-201ENST00000506984 490 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SP6Q3SY56 AC008957.1-202ENST00000512329 681 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.3 ms