Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 BPY2C-201ENST00000382287 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 BPY2B-201ENST00000382392 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 RPL23AP17-201ENST00000401064 499 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 AC009498.1-201ENST00000419860 541 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 LINC01762-201ENST00000423907 454 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 AC244035.2-201ENST00000425896 630 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 AL365220.1-201ENST00000432923 399 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 AL139161.2-201ENST00000438371 740 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 AL009050.1-201ENST00000445278 426 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 RAET1E-AS1-201ENST00000446954 491 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 LINC02083-201ENST00000462835 515 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 AC117386.1-201ENST00000474444 606 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 RPL38P3-201ENST00000484463 213 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 RN7SL284P-201ENST00000498823 275 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 RPL7L1P4-201ENST00000513004 707 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 LINC00861-202ENST00000517869 606 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 AC104212.3-201ENST00000522044 444 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 AP001804.1-201ENST00000526868 919 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 OR4A42P-201ENST00000531397 938 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 KLRC1-204ENST00000536188 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 LINC02412-201ENST00000552584 1269 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 DPPA3P2-201ENST00000553589 478 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 AC006530.1-201ENST00000555980 571 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 AC020978.7-201ENST00000575953 1187 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 AC008794.2-201ENST00000587779 293 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 AC145423.1-201ENST00000605712 336 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 AC079414.3-201ENST00000612986 1090 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 RN7SL787P-201ENST00000613000 284 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 AC004477.3-201ENST00000614061 590 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 C1orf195-202ENST00000625027 441 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 AP001043.1-201ENST00000626259 773 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 DBT-201ENST00000370131 1521 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 OXCT1-206ENST00000512084 1593 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 MDM4-216ENST00000616250 9597 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 CNOT1-202ENST00000441024 4999 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 AGBL1-201ENST00000441037 3551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 OOSP2-201ENST00000278855 1633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 SGMS2-203ENST00000394686 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 AP000641.1-201ENST00000531988 1639 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 ZC3H7A-214ENST00000575984 2632 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 AC005224.3-201ENST00000584683 2140 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 ZNF812P-201ENST00000457674 1694 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 CDH7-201ENST00000323011 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 ZNF214-204ENST00000536068 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 OR4G1P-202ENST00000641173 1788 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 AC134980.1-209ENST00000639059 2317 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 WDR95P-201ENST00000425638 1542 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 HIPK2-202ENST00000406875 15049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 OR51Q1-201ENST00000300778 1096 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 OR4S2-201ENST00000312422 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 RBMS3-AS2-201ENST00000366321 582 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 PPCS-201ENST00000372556 984 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 RN7SKP286-201ENST00000410894 299 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 Z68694.1-201ENST00000413929 841 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 TUBB4BP6-201ENST00000437576 479 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 AC019117.1-202ENST00000439046 589 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 LINC01781-202ENST00000443104 591 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 CASP5-205ENST00000444749 1237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 CASP12-206ENST00000446862 1196 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 MIS18A-AS1-201ENST00000453549 769 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 AC110749.1-201ENST00000462007 357 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 AL603882.1-201ENST00000463059 681 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 EFCAB10-203ENST00000480514 740 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 C5orf64-203ENST00000505642 2970 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 AC097537.1-201ENST00000514864 1213 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 PDE4D-225ENST00000515835 590 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 AC018793.4-201ENST00000524542 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 AP000873.2-203ENST00000528524 549 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 CASP5-209ENST00000531367 879 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 PCNAP4-201ENST00000532690 730 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 AL390816.1-201ENST00000553990 322 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 ZNF649-AS1-201ENST00000600329 579 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 AC069542.2-201ENST00000624816 216 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 PCBP1-AS1-282ENST00000625783 826 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 AC018793.2-201ENST00000639584 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 ATM-229ENST00000639953 587 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 AC018793.3-201ENST00000640805 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 OR51Q1-202ENST00000641085 1096 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 AC087269.2-201ENST00000641764 975 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 CCPG1-202ENST00000425574 1945 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 CSNK1G1-204ENST00000606793 1658 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 TMPRSS11BNL-202ENST00000510782 3202 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
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