Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 KALRN-204ENST00000360013 10806 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
FSCN1Q16658 CHN1-204ENST00000409597 1445 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
FSCN1Q16658 LCP2-201ENST00000046794 4678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
FSCN1Q16658 TPD52-203ENST00000448733 4339 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
FSCN1Q16658 EPG5-201ENST00000282041 12633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
FSCN1Q16658 SELE-201ENST00000333360 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
FSCN1Q16658 IKZF3-215ENST00000535189 1996 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
FSCN1Q16658 AL391262.1-201ENST00000556558 1992 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
FSCN1Q16658 ARRDC3-201ENST00000265138 4188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
FSCN1Q16658 CLCA3P-203ENST00000490028 2781 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
FSCN1Q16658 AC110597.1-201ENST00000562669 3176 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
FSCN1Q16658 VTCN1-201ENST00000328189 2289 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
FSCN1Q16658 PRRC1-202ENST00000442138 5504 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
FSCN1Q16658 MEPE-203ENST00000424957 2022 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
FSCN1Q16658 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
FSCN1Q16658 IGF2R-201ENST00000356956 14044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
FSCN1Q16658 BICRAL-202ENST00000394168 6515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
FSCN1Q16658 SELE-203ENST00000367775 3389 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
FSCN1Q16658 AC107980.1-201ENST00000558671 3355 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
FSCN1Q16658 MBNL3-206ENST00000394311 11263 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
FSCN1Q16658 MEF2C-249ENST00000637481 6088 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
FSCN1Q16658 AL136531.3-201ENST00000624378 3658 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
FSCN1Q16658 OR2M1P-201ENST00000318104 951 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
FSCN1Q16658 MIR323A-201ENST00000362199 86 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
FSCN1Q16658 SSX3-202ENST00000376893 800 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
FSCN1Q16658 AL159990.1-201ENST00000415119 337 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
FSCN1Q16658 AC011754.1-201ENST00000415201 491 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
FSCN1Q16658 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
FSCN1Q16658 AL451047.1-201ENST00000424451 814 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
FSCN1Q16658 AL159990.2-201ENST00000436491 337 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
FSCN1Q16658 CCDC13-AS1-202ENST00000446950 554 ntTSL 4 BASIC6.98□□□□□ -1.29
FSCN1Q16658 AL353633.1-201ENST00000458480 382 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
FSCN1Q16658 AC011476.1-201ENST00000466725 307 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
FSCN1Q16658 RN7SL273P-201ENST00000481561 299 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
FSCN1Q16658 AC091917.1-201ENST00000506330 566 ntTSL 4 BASIC6.98□□□□□ -1.29
FSCN1Q16658 AC114322.1-201ENST00000506771 926 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
FSCN1Q16658 AC010260.1-201ENST00000511484 664 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
FSCN1Q16658 LINC02358-201ENST00000514413 465 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
FSCN1Q16658 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
FSCN1Q16658 AC011632.2-201ENST00000520696 738 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
FSCN1Q16658 AC092490.1-202ENST00000540299 809 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
FSCN1Q16658 LINC02325-202ENST00000554260 567 ntTSL 4 BASIC6.98□□□□□ -1.29
FSCN1Q16658 TAT-AS1-201ENST00000561529 873 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
FSCN1Q16658 LINC02193-202ENST00000566864 719 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
FSCN1Q16658 AC233266.2-201ENST00000567067 528 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
FSCN1Q16658 AC109460.2-201ENST00000569974 544 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
FSCN1Q16658 AC005154.1-213ENST00000578572 445 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
FSCN1Q16658 AC005288.1-201ENST00000582842 860 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
FSCN1Q16658 AC107993.1-201ENST00000591343 684 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
FSCN1Q16658 AL513218.1-201ENST00000606527 391 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
FSCN1Q16658 AL096803.3-201ENST00000609032 532 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
FSCN1Q16658 AL391095.2-201ENST00000615228 378 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
FSCN1Q16658 AL645927.2-201ENST00000618350 349 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
FSCN1Q16658 AL445528.2-201ENST00000620582 470 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
FSCN1Q16658 AL450226.2-201ENST00000622913 439 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
FSCN1Q16658 AC099654.8-201ENST00000637757 681 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
FSCN1Q16658 AKAP7-201ENST00000263050 2238 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
FSCN1Q16658 DOCK9-203ENST00000376460 7549 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
FSCN1Q16658 MCTP2-208ENST00000557742 1957 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
FSCN1Q16658 LINC01903-201ENST00000580659 2149 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
FSCN1Q16658 IGF2BP3-218ENST00000619562 2126 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
FSCN1Q16658 SCN1A-204ENST00000423058 8191 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
FSCN1Q16658 ZNF320-205ENST00000595635 6448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
FSCN1Q16658 OOSP2-201ENST00000278855 1633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
FSCN1Q16658 SLC9A6-212ENST00000637195 4858 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
FSCN1Q16658 PKIB-211ENST00000615438 1936 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
FSCN1Q16658 TLR10-207ENST00000613579 3801 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
FSCN1Q16658 EOGT-201ENST00000295571 4138 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
FSCN1Q16658 ZNF474-201ENST00000296600 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
FSCN1Q16658 RAD17P2-201ENST00000451754 1977 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
FSCN1Q16658 AC007744.1-201ENST00000607540 2289 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
FSCN1Q16658 PRDM2-202ENST00000311066 7437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
FSCN1Q16658 TCL6-203ENST00000459662 3307 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
FSCN1Q16658 ZNF610-202ENST00000327920 1855 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
FSCN1Q16658 TMSB4XP2-201ENST00000335179 210 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
FSCN1Q16658 RNU1-24P-201ENST00000364285 165 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
FSCN1Q16658 DPYD-202ENST00000370192 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
FSCN1Q16658 SHC4-202ENST00000396535 2799 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
FSCN1Q16658 LINC02257-201ENST00000412445 605 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
FSCN1Q16658 AC245096.1-201ENST00000413104 546 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
FSCN1Q16658 Z68694.1-201ENST00000413929 841 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
FSCN1Q16658 AL713922.1-201ENST00000416477 747 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
FSCN1Q16658 AL669841.1-201ENST00000425723 558 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
FSCN1Q16658 AC137630.2-202ENST00000429681 555 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
FSCN1Q16658 AL133329.1-201ENST00000437466 478 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
FSCN1Q16658 AL583854.1-201ENST00000438818 613 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
FSCN1Q16658 AL354793.1-201ENST00000446028 713 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
FSCN1Q16658 AC099786.1-201ENST00000446238 670 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
FSCN1Q16658 RPS3AP53-201ENST00000454716 778 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
FSCN1Q16658 AC005304.1-201ENST00000457609 405 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
FSCN1Q16658 LARP7-210ENST00000509061 2332 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
FSCN1Q16658 NAA15-208ENST00000515576 2456 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
FSCN1Q16658 RNU6-319P-201ENST00000516025 108 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
FSCN1Q16658 SKP1-208ENST00000521216 899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
FSCN1Q16658 AC025300.1-201ENST00000526616 384 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
FSCN1Q16658 AL133240.1-201ENST00000553537 580 ntTSL 4 BASIC6.97□□□□□ -1.29
FSCN1Q16658 YWHAZP1-201ENST00000556286 722 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
FSCN1Q16658 ARPP19-204ENST00000563277 955 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
FSCN1Q16658 AC009054.1-201ENST00000568140 427 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
FSCN1Q16658 C16orf97-205ENST00000568524 406 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.6 ms