Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 AC013652.2-202ENST00000558948 910 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 AC002310.3-201ENST00000569728 723 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 AC063977.7-201ENST00000594454 337 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 IGKV2OR2-1-201ENST00000605129 304 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 AC022106.1-201ENST00000612834 766 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 RN7SL261P-201ENST00000613441 282 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 Xist_exon4.1-201ENST00000615964 126 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 AL589745.2-201ENST00000616366 555 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 AC009120.7-201ENST00000623452 780 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 COPS7B-225ENST00000631349 189 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 UGP2-232ENST00000640075 567 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 AC011416.1-201ENST00000514947 1732 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 TCF12-214ENST00000559710 1314 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 SLC12A1-201ENST00000330289 1764 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 NAT1-210ENST00000545197 1827 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 CRYBA1-201ENST00000225387 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 CLPS-201ENST00000259938 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 CD84-201ENST00000311224 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 ALKAL2-201ENST00000344414 449 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 SPINK14-201ENST00000356972 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 FAM66C-201ENST00000372173 678 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 AC087752.1-201ENST00000391360 558 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 YWHAZP4-201ENST00000392459 708 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 RNASE9-202ENST00000404716 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 MIR1282-201ENST00000408865 101 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 AL160004.1-201ENST00000434311 478 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 AC113331.2-201ENST00000445557 926 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 UBE2V2P4-201ENST00000447495 259 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 AC104339.1-201ENST00000465478 348 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 AC084211.1-201ENST00000473893 328 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 AC021006.1-201ENST00000489849 553 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 LINC02503-201ENST00000510505 812 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 AC025524.2-206ENST00000517953 439 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 NATP-201ENST00000523491 878 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 AC084125.1-201ENST00000525461 429 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 AC078922.1-201ENST00000547547 434 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 LINC02406-201ENST00000553029 546 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 AL049836.2-201ENST00000553318 513 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 RNASE9-205ENST00000553706 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 AC244502.3-201ENST00000555460 457 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 AL132989.1-201ENST00000557322 576 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 SPINK14-202ENST00000562793 157 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 AC090826.1-203ENST00000569235 490 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 SETP3-201ENST00000581726 813 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 AP001011.1-201ENST00000583546 690 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 AC079315.1-201ENST00000602952 623 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 AL050403.2-203ENST00000603180 558 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 SMAGP-208ENST00000605627 577 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 AC016590.3-201ENST00000611171 753 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 CLPS-202ENST00000616014 436 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 MIR6861-201ENST00000618657 64 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 AL122023.1-201ENST00000622847 530 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 AC022400.9-201ENST00000623633 273 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 AC111152.1-202ENST00000635848 339 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 AL355860.1-201ENST00000636087 1229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 AC104662.2-201ENST00000512921 1388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 AL158152.1-201ENST00000602652 1435 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 LINC01470-202ENST00000506723 2193 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 LINC02352-202ENST00000559292 1450 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 UBE3A-205ENST00000566215 3176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 APOOL-201ENST00000373173 1279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 AL807757.2-201ENST00000416455 779 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 KCNMA1-AS3-201ENST00000418515 701 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 AC074035.1-201ENST00000420725 1184 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 AC005532.1-201ENST00000430266 471 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 TEX41-206ENST00000432608 661 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 ARMC4P1-201ENST00000438905 707 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 AL136988.2-201ENST00000440729 861 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 SMIM30-204ENST00000441359 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 RPS10P18-201ENST00000442662 495 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 RN7SL552P-201ENST00000462094 276 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 AC079080.1-201ENST00000479841 822 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms