Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 SPINK13-203ENST00000512953 1022 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 OR8G5-201ENST00000524943 1041 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 AP001804.1-201ENST00000526868 919 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 AC103843.1-201ENST00000527318 682 ntTSL 4 BASIC9.33□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 AP001972.1-201ENST00000529215 506 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 DCN-209ENST00000546745 1026 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 AC040170.1-201ENST00000602425 564 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 LINC01355-202ENST00000604481 400 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 AC005252.1-201ENST00000604518 1063 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 AC005828.7-201ENST00000607331 556 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 AL445465.1-206ENST00000609544 528 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 AP000904.1-201ENST00000609911 951 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 AL137246.2-201ENST00000613439 662 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 Metazoa_SRP.66-201ENST00000615609 282 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 DRG1-207ENST00000629688 309 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 AL132640.3-201ENST00000630473 177 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 AC017104.5-201ENST00000637647 639 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 5S_rRNA.29-201ENST00000641250 107 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 SULT1C2-205ENST00000437390 1359 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 PLXNA4-201ENST00000321063 13061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 CXCL8-201ENST00000307407 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 LINC00700-201ENST00000413603 2097 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 OR2T29-202ENST00000641069 2637 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 AC098798.1-201ENST00000503998 1447 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 PCLO-203ENST00000423517 17147 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 TESPA1-210ENST00000531122 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 AL031656.1-202ENST00000457704 1995 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 RAPGEF4-204ENST00000409036 3975 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 RN7SKP184-201ENST00000362348 333 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 RN7SKP146-201ENST00000410242 334 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 AL391863.2-201ENST00000411838 681 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 AC004012.1-201ENST00000416593 534 ntTSL 4 BASIC9.32□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 SMARCE1P1-201ENST00000417747 1186 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 AL034397.2-201ENST00000424241 857 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 AL157884.1-201ENST00000424561 454 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 AC097721.1-201ENST00000427150 1253 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 MIR205HG-206ENST00000440276 539 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 RPS18P1-201ENST00000447840 458 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 SLC25A51P1-201ENST00000468432 871 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 RN7SL836P-201ENST00000476140 296 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 SH2D1A-203ENST00000477673 461 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 RPL29P23-201ENST00000486188 442 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 AC006296.1-201ENST00000514401 591 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 AC093816.1-201ENST00000515076 913 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 SNORA81.2-201ENST00000516868 170 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 NPM1P35-201ENST00000533043 868 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 SNHG1-212ENST00000539975 955 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 LINC02451-201ENST00000546982 565 ntTSL 4 BASIC9.32□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 RNASE11-208ENST00000555841 886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 LY86-AS1-206ENST00000607278 677 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 LINC00635-219ENST00000608506 482 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 STARD13-AS-235ENST00000609335 855 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 Metazoa_SRP.81-201ENST00000618466 316 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 ZNHIT3-208ENST00000619730 926 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 AL122023.1-201ENST00000622847 530 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 PTPN2-212ENST00000591497 3390 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 NAP1L1-227ENST00000618691 13505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 EEF1A1P24-201ENST00000451469 1378 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 AC092958.1-201ENST00000467198 2569 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 PRRC1-202ENST00000442138 5504 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 IGIP-201ENST00000333305 3458 ntAPPRIS P1 BASIC9.32□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 AC009804.2-201ENST00000637566 3032 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 MBNL2-202ENST00000345429 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 GPN1-205ENST00000458167 1618 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 SCARB2-207ENST00000638295 4507 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 ENTPD1-201ENST00000371205 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 SREK1-203ENST00000380918 2433 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 GABRB2-201ENST00000274547 7409 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 CCL1-201ENST00000225842 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 RPL11P4-201ENST00000332269 436 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 RNA5SP188-201ENST00000362916 129 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 TOMM6-202ENST00000398884 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 AC116036.1-201ENST00000412199 367 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 AL355390.2-201ENST00000446691 880 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 LINC01322-202ENST00000494915 594 ntTSL 4 BASIC9.31□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 AC131094.1-201ENST00000506984 490 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 AC116345.3-201ENST00000508255 449 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 SNORD116-30-201ENST00000516468 85 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 AC022915.3-201ENST00000518620 594 ntTSL 4 BASIC9.31□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 CHCHD7-210ENST00000521524 703 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 AL451137.1-201ENST00000523363 443 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 AP001318.3-202ENST00000528876 509 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 AC105233.3-201ENST00000531125 744 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 OSBPL9P5-201ENST00000542581 171 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 AC013652.2-202ENST00000558948 910 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
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