Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AC019133.1-201ENST00000508292 420 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 BMPR1APS2-201ENST00000527904 1012 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 CASP5-209ENST00000531367 879 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 AL136520.1-202ENST00000555494 763 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 AL356801.1-201ENST00000559320 294 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 LINC01533-201ENST00000585739 616 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 AL021368.3-201ENST00000607119 578 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 AC104307.1-201ENST00000616142 196 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 TCL6_3.1-201ENST00000619064 137 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 AC004808.2-201ENST00000627965 773 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 C1orf27-202ENST00000367470 3754 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 IQCM-205ENST00000636414 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 KIAA0586-214ENST00000619416 8233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 HERC2-201ENST00000261609 15337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 FTO-215ENST00000636491 1676 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 RIMKLB-207ENST00000538135 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 CHD2-215ENST00000628375 3202 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 TRAF5-201ENST00000261464 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 AL031651.1-201ENST00000615357 1438 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 OSBPL9-206ENST00000453295 2842 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 PLD1-202ENST00000351298 5604 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 ZNF542P-202ENST00000467807 3209 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 TMTC2-204ENST00000549919 6211 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 ELMOD2-201ENST00000323570 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 OR52B5P-204ENST00000641744 3467 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 RABGAP1L-218ENST00000489615 6821 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 GKN2-201ENST00000328895 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 RNA5SP333-201ENST00000363466 118 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 RNA5SP334-201ENST00000364825 118 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 RNU6-564P-201ENST00000410983 104 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 LIX1L-AS1-202ENST00000412239 570 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 AC245060.4-201ENST00000413293 1121 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 MARK2P12-201ENST00000420129 585 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 KIF4CP-201ENST00000422742 1279 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 AL392003.1-201ENST00000434394 243 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 CLUHP1-201ENST00000435012 1190 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 AL355355.1-201ENST00000442900 793 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 BMS1P10-201ENST00000443754 1120 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 AC087501.1-201ENST00000445617 715 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 AL022237.1-201ENST00000446663 358 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 RAET1E-AS1-201ENST00000446954 491 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 AC073072.2-201ENST00000447425 348 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 AL445665.1-202ENST00000452436 324 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 RIOK2-202ENST00000508447 2149 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 AC010425.1-201ENST00000511734 554 ntTSL 4 BASIC7.62□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 AC117525.1-201ENST00000515228 503 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 OR56A7P-201ENST00000524865 941 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 OR4A42P-201ENST00000531397 938 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 AC027544.3-201ENST00000535082 757 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 AL591770.1-201ENST00000554475 1131 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 ZNF322P1-201ENST00000568013 1209 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 AC087301.1-201ENST00000579037 321 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 MRO-208ENST00000588444 866 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 AC020916.2-201ENST00000591242 360 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC7.62□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 AC009237.12-201ENST00000604755 742 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 RPL12P48-201ENST00000605620 304 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 AC003992.1-201ENST00000635364 557 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 PRDM2-202ENST00000311066 7437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 MYPN-204ENST00000540630 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 TXNRD1-205ENST00000503506 3930 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 OGT-202ENST00000373719 5461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 NFAT5-202ENST00000354436 13229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 OR52I2-203ENST00000641896 6591 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 CLEC12A-205ENST00000434319 1515 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 TCF7L2-218ENST00000538897 4000 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 GABRR1-206ENST00000611484 3259 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 ADH7-202ENST00000437033 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 AC110716.2-201ENST00000563865 3945 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 AP001636.3-201ENST00000533954 2810 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 LRRC39-202ENST00000370137 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 LINC00702-203ENST00000608792 6300 ntTSL 4 BASIC7.61□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 SLC17A8-201ENST00000323346 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 ADA2-206ENST00000449907 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 SLC9A6-212ENST00000637195 4858 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 OR13C1P-202ENST00000641378 2919 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 OR8H1-201ENST00000313022 1038 ntAPPRIS P2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC7.61□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 RNU6-670P-201ENST00000364312 104 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 AL607077.1-201ENST00000401718 499 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 KCNJ13-202ENST00000409779 1099 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 LINC02257-201ENST00000412445 605 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 AC007389.1-203ENST00000414811 556 ntTSL 4 BASIC7.61□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 FO393401.1-203ENST00000416260 486 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 RPL12P43-201ENST00000420608 499 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 G6PC2-203ENST00000421979 494 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 CLYBL-AS2-201ENST00000430125 695 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 LINC00383-201ENST00000433664 817 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 AL121759.1-201ENST00000434043 795 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 AL451136.1-201ENST00000435399 325 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 C21orf91-OT1-203ENST00000439392 497 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93 ms