Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 AC010387.1-201ENST00000507526 487 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 TMEM68-213ENST00000522576 826 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 AP000873.2-204ENST00000530825 375 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 LINC02451-201ENST00000546982 565 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 BICD1-206ENST00000551086 423 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 LINC00929-203ENST00000556213 713 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 AL162464.1-201ENST00000557642 554 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 INO80-AS1-201ENST00000558967 312 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 AC073941.1-201ENST00000559148 539 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 AC011468.1-201ENST00000569091 675 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 AC130371.1-201ENST00000577023 230 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 AP005119.1-201ENST00000580956 292 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 AC233702.7-202ENST00000582941 211 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 AC027229.1-201ENST00000583887 253 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 AC009303.3-201ENST00000591103 736 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 LINC01999-201ENST00000592917 646 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 AC243960.3-202ENST00000599770 594 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 AC108673.3-201ENST00000609183 335 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 Metazoa_SRP.70-201ENST00000612622 273 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 AC096708.4-201ENST00000620563 552 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 AC005154.1-203ENST00000626245 451 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 AC084816.1-204ENST00000628326 631 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 OR7A1P-202ENST00000641542 1158 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 PDE1A-204ENST00000410103 2000 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 CLEC4E-201ENST00000299663 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 TYW3-203ENST00000457880 3335 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 SLC35F5-213ENST00000638402 1554 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 TMPRSS11BNL-202ENST00000510782 3202 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 RASSF8-213ENST00000542865 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 CNTRL-204ENST00000373847 3372 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 SETDB2-201ENST00000258672 2138 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 TPMT-201ENST00000309983 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 CREM-203ENST00000344351 1625 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 MECOM-209ENST00000472280 3593 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 AC105749.1-201ENST00000631338 2008 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 BCORP1-202ENST00000441139 3461 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 BIN2P1-201ENST00000504996 1530 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 CPS1-212ENST00000619804 1542 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 PHEX-AS1-201ENST00000424650 1906 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 FAM197Y8-201ENST00000426661 2340 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
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CHAF1AQ13111 PAGE2-202ENST00000374968 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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CHAF1AQ13111 DZIP3-202ENST00000463306 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 TLR10-207ENST00000613579 3801 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
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CHAF1AQ13111 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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CHAF1AQ13111 KAT7-203ENST00000435742 3638 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 AL731532.1-201ENST00000623972 4236 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 RCAN2-201ENST00000306764 3240 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 TRIM64-201ENST00000533122 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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CHAF1AQ13111 AC099673.1-201ENST00000452199 2296 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 DAOA-202ENST00000375936 742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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CHAF1AQ13111 TMBIM4-203ENST00000398033 844 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 ABCA12-203ENST00000412081 485 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 AC116036.1-201ENST00000412199 367 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 AC245096.1-201ENST00000413104 546 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 AC078883.1-203ENST00000416080 654 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 AL391987.1-201ENST00000441025 200 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 AL590399.3-202ENST00000448491 495 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 AC002075.1-201ENST00000457396 676 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 AGGF1P3-201ENST00000493675 1213 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
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