Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 VPS29-210ENST00000552130 1057 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
IRX1P78414 AL163195.3-202ENST00000555283 578 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
IRX1P78414 AL161757.5-202ENST00000556696 570 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
IRX1P78414 LINC01146-207ENST00000557339 397 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
IRX1P78414 AL390726.5-202ENST00000564800 256 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
IRX1P78414 AC126323.5-201ENST00000569913 592 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
IRX1P78414 AC040173.1-201ENST00000572479 580 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
IRX1P78414 DSG1-AS1-202ENST00000578477 588 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
IRX1P78414 ABHD15-AS1-201ENST00000581474 187 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
IRX1P78414 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
IRX1P78414 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
IRX1P78414 AC005332.4-201ENST00000592752 579 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
IRX1P78414 LINC01198-204ENST00000594153 552 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
IRX1P78414 AC020914.2-201ENST00000598220 430 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
IRX1P78414 AC036176.3-201ENST00000602456 418 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
IRX1P78414 AC015819.1-201ENST00000613588 663 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
IRX1P78414 AC244517.6-202ENST00000623884 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
IRX1P78414 AF067845.4-201ENST00000633198 480 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
IRX1P78414 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
IRX1P78414 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
IRX1P78414 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
IRX1P78414 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
IRX1P78414 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
IRX1P78414 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
IRX1P78414 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
IRX1P78414 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
IRX1P78414 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
IRX1P78414 ZNF480-201ENST00000334564 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
IRX1P78414 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
IRX1P78414 MAK-205ENST00000538030 2459 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
IRX1P78414 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
IRX1P78414 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
IRX1P78414 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
IRX1P78414 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
IRX1P78414 EIF1AY-201ENST00000361365 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
IRX1P78414 SSH2-204ENST00000540801 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.45
IRX1P78414 AC005703.1-201ENST00000431343 1773 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
IRX1P78414 ABCA6-206ENST00000590645 1511 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
IRX1P78414 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
IRX1P78414 SEMA5A-AS1-201ENST00000510879 1679 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
IRX1P78414 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
IRX1P78414 FETUB-203ENST00000382136 1040 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
IRX1P78414 MIR191-201ENST00000384873 92 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
IRX1P78414 SNORD94-201ENST00000386037 137 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
IRX1P78414 AL353133.1-201ENST00000407695 401 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
IRX1P78414 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
IRX1P78414 AF127936.1-201ENST00000435315 695 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
IRX1P78414 RPSAP41-201ENST00000439695 860 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
IRX1P78414 TCEA1P3-201ENST00000443005 880 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
IRX1P78414 AL139161.1-201ENST00000443207 190 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
IRX1P78414 KRTAP2-5P-201ENST00000446109 396 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
IRX1P78414 RN7SKP198-201ENST00000459286 306 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
IRX1P78414 AC114982.2-201ENST00000461396 358 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
IRX1P78414 RN7SL741P-201ENST00000482473 289 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
IRX1P78414 AC016746.1-201ENST00000489557 831 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
IRX1P78414 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
IRX1P78414 AC112206.2-204ENST00000504068 793 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
IRX1P78414 LINC02502-201ENST00000505122 642 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
IRX1P78414 MINOS1P4-201ENST00000515470 318 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
IRX1P78414 LINC01484-201ENST00000517733 555 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
IRX1P78414 IGLVVII-41-1-201ENST00000518405 151 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
IRX1P78414 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
IRX1P78414 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
IRX1P78414 AP003028.1-203ENST00000525832 444 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
IRX1P78414 CTNNA3-205ENST00000545309 555 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
IRX1P78414 AL357153.3-201ENST00000553982 611 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
IRX1P78414 AC090519.2-201ENST00000559034 655 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
IRX1P78414 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
IRX1P78414 AC092376.1-201ENST00000569677 335 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
IRX1P78414 AC015912.1-201ENST00000574826 538 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
IRX1P78414 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
IRX1P78414 AC091132.1-201ENST00000588189 547 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
IRX1P78414 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
IRX1P78414 AL355974.3-201ENST00000617383 467 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
IRX1P78414 CLUHP10-201ENST00000631979 980 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
IRX1P78414 TMEM30CP-203ENST00000637814 1035 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
IRX1P78414 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
IRX1P78414 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
IRX1P78414 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
IRX1P78414 AC019080.1-201ENST00000397057 5202 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
IRX1P78414 MAP3K19-206ENST00000392918 1460 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
IRX1P78414 AC008163.1-201ENST00000636281 1455 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
IRX1P78414 C8orf34-AS1-201ENST00000512294 1600 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
IRX1P78414 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
IRX1P78414 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
IRX1P78414 CDC14A-206ENST00000635056 2056 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
IRX1P78414 PAPD4-203ENST00000428308 2204 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
IRX1P78414 NLRC4-202ENST00000360906 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
IRX1P78414 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
IRX1P78414 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
IRX1P78414 MIR4435-2HG-207ENST00000439362 1522 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
IRX1P78414 MTRNR2L3-201ENST00000543500 1539 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
IRX1P78414 INTS12-211ENST00000618810 1502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
IRX1P78414 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
IRX1P78414 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
IRX1P78414 AC010894.1-201ENST00000313760 361 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
IRX1P78414 ZNF66-202ENST00000360204 1120 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
IRX1P78414 SNORD35A-201ENST00000363389 86 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
IRX1P78414 SNORA43.1-201ENST00000364863 140 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
IRX1P78414 HSPB11-202ENST00000371376 765 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.8 ms