Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 ST13P12-201ENST00000508958 1094 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
NMBRP28336 AC008601.1-201ENST00000519892 527 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
NMBRP28336 AC103726.2-201ENST00000523318 411 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
NMBRP28336 KCTD21-AS1-203ENST00000527321 586 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
NMBRP28336 HNRNPCP1-201ENST00000556181 766 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
NMBRP28336 INO80-AS1-201ENST00000558967 312 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
NMBRP28336 AP001007.3-201ENST00000560744 356 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
NMBRP28336 AC092332.1-201ENST00000563684 829 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
NMBRP28336 GARSP1-201ENST00000570895 719 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
NMBRP28336 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
NMBRP28336 MIR4502-201ENST00000580432 81 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
NMBRP28336 AC073218.2-202ENST00000605962 617 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
NMBRP28336 Z98949.1-220ENST00000609809 804 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
NMBRP28336 AC096708.4-201ENST00000620563 552 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
NMBRP28336 IL1R1-202ENST00000409329 1862 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
NMBRP28336 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
NMBRP28336 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
NMBRP28336 AC006305.1-201ENST00000382897 2558 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
NMBRP28336 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
NMBRP28336 GCSAML-210ENST00000536561 4063 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
NMBRP28336 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
NMBRP28336 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
NMBRP28336 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
NMBRP28336 NAV3-201ENST00000397909 9821 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
NMBRP28336 PPBPP2-201ENST00000513150 1362 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
NMBRP28336 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
NMBRP28336 CDH7-201ENST00000323011 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
NMBRP28336 CASC8-203ENST00000502082 1420 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
NMBRP28336 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NMBRP28336 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NMBRP28336 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NMBRP28336 ZC3H7A-214ENST00000575984 2632 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
NMBRP28336 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
NMBRP28336 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
NMBRP28336 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
NMBRP28336 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NMBRP28336 Y_RNA.62-201ENST00000362840 99 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
NMBRP28336 RNU6-891P-201ENST00000384280 111 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
NMBRP28336 PPP1R7-203ENST00000401987 820 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NMBRP28336 AC114803.1-201ENST00000417355 311 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NMBRP28336 KIF4CP-201ENST00000422742 1279 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
NMBRP28336 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NMBRP28336 AL603840.1-203ENST00000424357 645 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NMBRP28336 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NMBRP28336 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NMBRP28336 HNRNPA1P18-201ENST00000433537 927 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
NMBRP28336 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NMBRP28336 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NMBRP28336 AC097463.1-201ENST00000447288 481 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
NMBRP28336 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
NMBRP28336 OR6C72P-201ENST00000451403 892 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
NMBRP28336 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
NMBRP28336 AC021006.1-201ENST00000489849 553 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
NMBRP28336 AC092349.1-201ENST00000504903 310 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
NMBRP28336 RNU6-1334P-201ENST00000516032 105 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
NMBRP28336 OR52B2-201ENST00000530810 1079 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NMBRP28336 AC103996.3-201ENST00000553477 442 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NMBRP28336 LINC00907-202ENST00000585639 915 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
NMBRP28336 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
NMBRP28336 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
NMBRP28336 AC003682.1-201ENST00000599190 462 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NMBRP28336 LINC01435-212ENST00000601212 742 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NMBRP28336 AL352984.2-202ENST00000613699 155 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
NMBRP28336 AL138960.1-201ENST00000613838 513 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
NMBRP28336 ATP13A5-205ENST00000620313 709 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NMBRP28336 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
NMBRP28336 NBPF9-203ENST00000610300 2930 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
NMBRP28336 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NMBRP28336 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
NMBRP28336 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
NMBRP28336 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
NMBRP28336 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
NMBRP28336 MEIOB-205ENST00000470044 1857 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NMBRP28336 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NMBRP28336 NPY5R-202ENST00000506953 1418 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NMBRP28336 DDX4-211ENST00000511853 1984 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NMBRP28336 CDKL5-205ENST00000623535 12533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
NMBRP28336 LIN7C-201ENST00000278193 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
NMBRP28336 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NMBRP28336 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NMBRP28336 AC090181.3-201ENST00000624777 1514 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NMBRP28336 FUNDC2P3-201ENST00000334716 533 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NMBRP28336 STMN1-202ENST00000374291 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NMBRP28336 TMBIM4-203ENST00000398033 844 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
NMBRP28336 RPS21P8-201ENST00000413365 247 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NMBRP28336 AL512353.1-202ENST00000416809 627 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NMBRP28336 PLA2G12AP2-201ENST00000424744 264 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NMBRP28336 AC006455.6-201ENST00000426192 893 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NMBRP28336 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
NMBRP28336 GAPDHP75-201ENST00000433910 943 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NMBRP28336 PNKDP1-201ENST00000435914 430 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NMBRP28336 UBE2L5P-201ENST00000436446 465 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NMBRP28336 BMS1P10-201ENST00000443754 1120 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NMBRP28336 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NMBRP28336 AC004129.2-201ENST00000457229 287 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NMBRP28336 AC079080.1-201ENST00000479841 822 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NMBRP28336 AC093719.1-201ENST00000480427 441 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NMBRP28336 RABGAP1L-216ENST00000486220 772 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
NMBRP28336 AC008413.2-201ENST00000507398 342 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NMBRP28336 PMP2-202ENST00000519260 1264 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.7 ms