Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 AC010198.2-201ENST00000550612 259 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
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FOXQ1Q9C009 RN7SL656P-201ENST00000579044 281 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 RN7SL270P-201ENST00000579643 281 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 Metazoa_SRP.202-201ENST00000585071 281 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
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FOXQ1Q9C009 Metazoa_SRP.35-201ENST00000611402 288 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 CNTNAP3P1-201ENST00000616657 906 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 AC022400.9-201ENST00000623633 273 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 AC130456.6-201ENST00000623745 765 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 FP325313.1-201ENST00000638228 703 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 AD000090.1-201ENST00000638356 494 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
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FOXQ1Q9C009 DNAJC6-201ENST00000263441 5916 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 MAGEB10-202ENST00000614159 1389 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
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FOXQ1Q9C009 LPAR1-202ENST00000374430 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 IL13RA2-202ENST00000371936 1498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 NXF4-202ENST00000416098 1465 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 AC006042.3-201ENST00000454684 1469 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 ABI1-202ENST00000359188 3492 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 GPR1-AS-201ENST00000623040 3708 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 EIF4G2-202ENST00000396525 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
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FOXQ1Q9C009 UGT2B24P-201ENST00000514441 1597 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
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FOXQ1Q9C009 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 AC010325.3-201ENST00000641084 394 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 AIM2-202ENST00000368130 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 LINC02431-202ENST00000505329 1788 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 THAP12P7-201ENST00000520248 2290 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 TTTY10-202ENST00000455084 1628 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 HSPA8P11-201ENST00000508840 1898 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
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