Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 AL589765.6-201ENST00000601909 549 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 AL157899.1-201ENST00000604110 936 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 QTRT1P1-201ENST00000604344 1078 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 AC092902.2-219ENST00000608488 822 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 AL512506.1-201ENST00000613918 449 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 AC012676.3-201ENST00000614983 479 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 AC005393.1-201ENST00000617916 584 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 MMP2-AS1-203ENST00000620495 625 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 BRCC3-209ENST00000620502 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 OR10X1-201ENST00000623167 981 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 AC119674.1-202ENST00000641333 1860 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 PLEKHH2-201ENST00000282406 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 HORMAD2-202ENST00000403975 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 LUZP2-201ENST00000336930 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 TEX11-202ENST00000374320 2224 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 KIF27-204ENST00000413982 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 SOHLH2-202ENST00000379881 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 MBNL2-202ENST00000345429 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 C5orf64-203ENST00000505642 2970 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 AC023245.2-201ENST00000530760 2978 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 ZNF766-201ENST00000439461 6298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 WDR35-201ENST00000281405 6918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 PIGN-220ENST00000638167 4195 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP485-201ENST00000365053 119 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 PRPS1-202ENST00000372419 628 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 LINC00396-201ENST00000411690 439 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 AL360013.1-201ENST00000419031 858 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 AC002127.1-201ENST00000421305 225 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 AC244453.3-201ENST00000426275 459 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 ZRANB2-AS1-201ENST00000426999 607 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 AC083862.1-201ENST00000427378 1242 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 RPSAP32-201ENST00000432681 526 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 CFAP58-AS1-201ENST00000435434 795 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 AL022310.1-201ENST00000436974 690 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 AP006216.1-201ENST00000439104 419 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 AC079763.1-201ENST00000441295 738 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 AL731574.1-201ENST00000447757 456 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 MGAT2P1-201ENST00000449718 797 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 RPL23AP64-201ENST00000469465 435 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 STRADBP1-201ENST00000478954 1281 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 RPL37P23-201ENST00000492641 294 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 AC018645.1-201ENST00000505003 109 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 AC122718.2-201ENST00000505325 591 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 AC083906.1-201ENST00000509298 406 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 AC239584.1-201ENST00000510419 732 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 AC093816.1-201ENST00000515076 913 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 AC022915.3-201ENST00000518620 594 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 H2AFV-208ENST00000521529 439 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 AC008662.1-201ENST00000521805 674 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 AP002954.1-201ENST00000526274 425 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 AC022509.1-202ENST00000537525 494 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 AC008147.3-201ENST00000548666 354 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 TMEM106C-215ENST00000550552 776 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 AL121839.1-201ENST00000556233 1185 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 AC090888.3-201ENST00000558917 509 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 AC007014.1-201ENST00000572828 610 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 AC007786.1-202ENST00000590607 443 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 ZNF649-AS1-201ENST00000600329 579 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 BUB1P1-201ENST00000603541 607 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 PCGEM1-202ENST00000606314 759 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 AC135803.1-201ENST00000608748 565 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 FGF1-213ENST00000610990 3802 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 Metazoa_SRP.66-201ENST00000615609 282 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 AC012653.2-201ENST00000621880 420 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 MIR6806-201ENST00000622141 64 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 5S_rRNA.29-201ENST00000641250 107 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 KCNJ1-203ENST00000392664 1674 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 AL512283.1-201ENST00000606756 1384 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 AC025428.2-201ENST00000435367 2672 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 FGF1-216ENST00000621536 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 MBNL3-206ENST00000394311 11263 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 ITGB1-201ENST00000302278 3640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 BICRAL-202ENST00000394168 6515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 LINC01440-201ENST00000416190 1340 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 SLC17A4-202ENST00000397076 2331 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 SLC38A9-218ENST00000512595 1756 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 ZNF528-201ENST00000360465 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms