Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAPPC6BQ86SZ2 ZSCAN4-201ENST00000318203 2246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAPPC6BQ86SZ2 CTAGE5-201ENST00000280082 2554 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAPPC6BQ86SZ2 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAPPC6BQ86SZ2 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF23-207ENST00000564528 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAPPC6BQ86SZ2 C4orf36-203ENST00000473559 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAPPC6BQ86SZ2 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAPPC6BQ86SZ2 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAPPC6BQ86SZ2 TCEAL8-201ENST00000360000 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAPPC6BQ86SZ2 RNA5SP232-201ENST00000364144 119 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAPPC6BQ86SZ2 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAPPC6BQ86SZ2 FCGR1B-202ENST00000369383 570 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAPPC6BQ86SZ2 TCEAL8-202ENST00000372685 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAPPC6BQ86SZ2 THEM7P-201ENST00000419556 672 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAPPC6BQ86SZ2 RPL12P12-201ENST00000424633 501 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAPPC6BQ86SZ2 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAPPC6BQ86SZ2 ZEB2-AS1-203ENST00000428623 436 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAPPC6BQ86SZ2 AC108479.1-201ENST00000431142 427 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAPPC6BQ86SZ2 KATNBL1P2-201ENST00000433311 835 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAPPC6BQ86SZ2 AL358074.1-201ENST00000444800 509 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAPPC6BQ86SZ2 AC010240.2-201ENST00000445363 1205 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAPPC6BQ86SZ2 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAPPC6BQ86SZ2 MIR205HG-209ENST00000458250 406 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAPPC6BQ86SZ2 AC098818.1-201ENST00000478593 252 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAPPC6BQ86SZ2 AC083795.1-201ENST00000491760 320 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAPPC6BQ86SZ2 RN7SL362P-201ENST00000494228 267 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAPPC6BQ86SZ2 AC112484.3-201ENST00000505910 329 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC02196-201ENST00000512838 568 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAPPC6BQ86SZ2 IGKV1OR22-1-201ENST00000521497 360 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAPPC6BQ86SZ2 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAPPC6BQ86SZ2 AP002370.2-202ENST00000533669 908 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAPPC6BQ86SZ2 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAPPC6BQ86SZ2 KLRK1-204ENST00000540818 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC02420-201ENST00000543387 741 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAPPC6BQ86SZ2 AC084824.2-201ENST00000548906 345 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAPPC6BQ86SZ2 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAPPC6BQ86SZ2 AC005544.1-201ENST00000584277 460 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAPPC6BQ86SZ2 CBLN2-208ENST00000584764 543 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF682-208ENST00000596019 552 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAPPC6BQ86SZ2 AC244100.4-201ENST00000617747 388 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAPPC6BQ86SZ2 AC005899.7-201ENST00000618199 588 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM27E2-201ENST00000619668 403 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAPPC6BQ86SZ2 COPS7B-225ENST00000631349 189 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAPPC6BQ86SZ2 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAPPC6BQ86SZ2 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAPPC6BQ86SZ2 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAPPC6BQ86SZ2 MTCO1P28-201ENST00000574177 1528 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF112-201ENST00000337401 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAPPC6BQ86SZ2 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAPPC6BQ86SZ2 LRRC37A3-202ENST00000334962 2654 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAPPC6BQ86SZ2 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAPPC6BQ86SZ2 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAPPC6BQ86SZ2 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRAPPC6BQ86SZ2 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC6BQ86SZ2 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC6BQ86SZ2 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC6BQ86SZ2 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC6BQ86SZ2 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC6BQ86SZ2 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01153-201ENST00000429809 2864 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC6BQ86SZ2 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC6BQ86SZ2 RNU1-134P-201ENST00000362935 165 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC6BQ86SZ2 YWHAZP6-201ENST00000399764 738 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC6BQ86SZ2 FIGN-202ENST00000409634 746 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC6BQ86SZ2 AC017048.1-201ENST00000412153 495 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC6BQ86SZ2 RPL35AP31-201ENST00000418340 337 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC6BQ86SZ2 OR5W1P-201ENST00000423705 938 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC6BQ86SZ2 AC130360.1-201ENST00000425489 1117 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC6BQ86SZ2 AL022337.1-201ENST00000434510 357 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC6BQ86SZ2 AC242426.1-201ENST00000435270 960 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC6BQ86SZ2 UBE2L5P-201ENST00000436446 465 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC6BQ86SZ2 MTND2P40-201ENST00000436718 841 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC6BQ86SZ2 HMGB1P7-201ENST00000450921 612 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC6BQ86SZ2 AC002553.3-201ENST00000453002 341 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC6BQ86SZ2 AL035443.1-201ENST00000456631 304 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC6BQ86SZ2 PFN1P6-201ENST00000476786 399 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC6BQ86SZ2 RN7SL568P-201ENST00000493069 298 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC6BQ86SZ2 JCHAIN-204ENST00000510437 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC6BQ86SZ2 HMGN1P17-201ENST00000513734 295 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC6BQ86SZ2 AC025366.1-201ENST00000523264 202 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC6BQ86SZ2 AC084125.1-201ENST00000525461 429 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC6BQ86SZ2 AC130365.2-201ENST00000525882 1201 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC6BQ86SZ2 NPIPA8-202ENST00000541810 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC6BQ86SZ2 NPIPA3-203ENST00000552140 1053 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC6BQ86SZ2 NPIPA2-203ENST00000553201 1053 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01579-205ENST00000556447 791 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC6BQ86SZ2 AC007346.1-201ENST00000569208 867 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC6BQ86SZ2 AL163952.1-202ENST00000569625 600 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF174-204ENST00000572544 1002 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC6BQ86SZ2 SNHG8-202ENST00000602483 309 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC6BQ86SZ2 SMIM12P1-201ENST00000603004 274 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC6BQ86SZ2 AC073333.2-201ENST00000603589 769 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC6BQ86SZ2 AL353729.2-201ENST00000605859 1249 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC6BQ86SZ2 Metazoa_SRP.35-201ENST00000611402 288 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC6BQ86SZ2 AC005618.4-201ENST00000625053 554 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC6BQ86SZ2 DARS-AS1-227ENST00000627442 633 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC6BQ86SZ2 AC084816.1-204ENST00000628326 631 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC6BQ86SZ2 AL357140.4-201ENST00000636827 412 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms