Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

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Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 USP50-203ENST00000532404 1386 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 CHD2-208ENST00000626874 7764 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 ZNF507-203ENST00000544431 5764 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 LRMDA-208ENST00000496424 3923 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 STIL-201ENST00000337817 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 AP000547.3-204ENST00000588548 2523 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 NAV3-202ENST00000536525 7386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 AC125793.1-201ENST00000565238 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 TRIM51-201ENST00000244891 1329 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 GOLT1B-201ENST00000229314 3227 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 ANLN-202ENST00000396068 4661 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 ZNF112-201ENST00000337401 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 LRRC37A3-203ENST00000339474 2589 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 MCM10-201ENST00000378694 4587 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 MTHFD2L-207ENST00000433372 1407 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 RORA-203ENST00000335670 10844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 DAOA-202ENST00000375936 742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 ZSCAN12P1-201ENST00000406489 419 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 FIGN-202ENST00000409634 746 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 LINC01829-201ENST00000414404 571 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 RPL34P3-201ENST00000421454 338 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 AL627308.1-201ENST00000435693 821 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 ZNF619P1-201ENST00000446539 752 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 VN1R38P-201ENST00000450265 887 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 MTND2P3-201ENST00000452458 470 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 GEMIN2P1-201ENST00000454246 752 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 AC090993.1-201ENST00000522460 582 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 LINC01033-204ENST00000523194 715 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 PCNAP4-201ENST00000532690 730 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 AC090592.1-202ENST00000533049 568 ntTSL 4 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 AC098850.3-201ENST00000577569 771 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 AP001496.3-201ENST00000580230 913 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 AC245128.3-201ENST00000594721 748 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 AL953862.2-201ENST00000603089 820 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 AC006924.1-201ENST00000610750 559 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 CCL4-202ENST00000615863 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 AP001885.1-201ENST00000621658 558 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 PCBP1-AS1-286ENST00000625888 765 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 ICE2P1-201ENST00000512800 1849 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 CEP120-202ENST00000306481 4629 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 CREB5-201ENST00000357727 8532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 ZNF484-202ENST00000375495 2867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 AC134980.1-209ENST00000639059 2317 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 TMEM161B-211ENST00000512429 1796 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 LGALS17A-201ENST00000412609 2562 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 ZNF192P1-201ENST00000440790 1628 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 LGSN-204ENST00000622415 1612 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 NCOR1-204ENST00000395851 7950 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 PLRG1-202ENST00000499023 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 AC137056.2-201ENST00000624055 1958 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 LRRC37B-202ENST00000341671 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 AC013488.1-201ENST00000526618 1838 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 OLMALINC-203ENST00000641087 3779 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 CNTRL-204ENST00000373847 3372 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 MEF2C-225ENST00000625585 3467 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
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CCDC93Q567U6 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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CCDC93Q567U6 AC084816.1-201ENST00000413794 565 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
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CCDC93Q567U6 LINC01780-202ENST00000457683 391 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 RN7SL799P-201ENST00000475891 298 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 CASP5-209ENST00000531367 879 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 LINC00911-201ENST00000555272 546 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
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CCDC93Q567U6 ULK4P1-201ENST00000564495 875 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 AC090286.3-201ENST00000573133 187 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 AC099850.2-201ENST00000577660 557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 RPL12P48-201ENST00000605620 304 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 AL391597.1-201ENST00000618707 694 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 OR2G6-202ENST00000641501 5840 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 LINC01920-201ENST00000441356 2528 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 NCOA6-202ENST00000374796 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 LINC01450-201ENST00000443406 3263 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 C2orf16-201ENST00000408964 6200 ntAPPRIS P2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 MUC5AC-201ENST00000621226 17448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 AASDH-203ENST00000502617 3004 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 OR8D4-201ENST00000321355 1331 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 AC233968.1-201ENST00000611212 1300 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 AC022417.1-201ENST00000624768 1303 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 PATJ-203ENST00000371158 8505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 SNX18P3-202ENST00000565670 1750 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
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