Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 LINC02303-204ENST00000555442 889 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AL158801.3-201ENST00000555514 363 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AC099314.1-201ENST00000563916 562 ntTSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AC023827.2-201ENST00000566880 1061 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
FXNQ16595 MIR4262-201ENST00000578394 54 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
FXNQ16595 RN7SL42P-201ENST00000579786 294 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AP005136.2-201ENST00000583253 1049 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AC005537.1-202ENST00000585996 666 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AL390058.1-201ENST00000603834 629 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AP005328.2-201ENST00000606879 657 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
FXNQ16595 OR6L2P-201ENST00000608207 925 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AL136097.3-201ENST00000611097 505 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AL356274.1-201ENST00000617064 410 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AP001962.1-201ENST00000624114 559 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
FXNQ16595 PDAP1-205ENST00000626285 120 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AC241377.2-202ENST00000636462 997 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
FXNQ16595 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AP000842.4-201ENST00000638781 748 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AC134980.1-214ENST00000638815 687 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AC018793.5-201ENST00000640302 585 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AL354702.2-202ENST00000641481 890 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
FXNQ16595 OR2AK2-202ENST00000641852 1008 ntAPPRIS P2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
FXNQ16595 CAP1P2-201ENST00000417455 1409 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
FXNQ16595 KYNUP1-201ENST00000466683 1406 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
FXNQ16595 LINC00862-204ENST00000637098 1400 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AKAP17BP-201ENST00000431706 2719 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
FXNQ16595 ZNF83-205ENST00000594682 2890 ntTSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
FXNQ16595 VPS53-204ENST00000437048 13106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
FXNQ16595 ARHGAP28-207ENST00000532996 1859 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
FXNQ16595 GLRA2-204ENST00000443437 3182 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
FXNQ16595 PARP4P1-201ENST00000435945 2337 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
FXNQ16595 FAM227A-205ENST00000535113 10322 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
FXNQ16595 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
FXNQ16595 GDNF-AS1-202ENST00000510986 1941 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
FXNQ16595 OR2G6-202ENST00000641501 5840 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
FXNQ16595 NEDD9-216ENST00000620854 4086 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
FXNQ16595 HSD17B4-202ENST00000414835 2551 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.33
FXNQ16595 HEATR1-202ENST00000366581 6538 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
FXNQ16595 POF1B-202ENST00000373145 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
FXNQ16595 PIK3R3-202ENST00000372006 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
FXNQ16595 GALNTL5-206ENST00000431418 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
FXNQ16595 ZNF107-206ENST00000620827 5685 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC6.71□□□□□ -1.33
FXNQ16595 ZNF90-201ENST00000418063 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
FXNQ16595 HSP90AA2P-201ENST00000530115 2196 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.33
FXNQ16595 METTL8-217ENST00000612742 8132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
FXNQ16595 DYRK1A-201ENST00000338785 5498 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
FXNQ16595 ASNS-214ENST00000455086 1588 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
FXNQ16595 PHLDB2-201ENST00000393923 5673 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AC015969.1-201ENST00000366218 1416 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
FXNQ16595 CASC19-206ENST00000641028 1430 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
FXNQ16595 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AC123769.1-201ENST00000530992 3192 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
FXNQ16595 KLRG1-202ENST00000356986 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
FXNQ16595 SGMS1-201ENST00000361543 1096 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
FXNQ16595 RNU4-4P-201ENST00000364588 130 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
FXNQ16595 RNA5SP238-201ENST00000365464 120 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
FXNQ16595 CLK1-203ENST00000409769 1192 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
FXNQ16595 EEF1GP7-201ENST00000422983 703 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
FXNQ16595 OR6K4P-201ENST00000423179 955 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
FXNQ16595 ETDB-201ENST00000423661 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
FXNQ16595 ETDB-202ENST00000426364 388 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
FXNQ16595 SNX18P14-201ENST00000429308 574 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AC099796.1-201ENST00000433377 683 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
FXNQ16595 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
FXNQ16595 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AL157359.2-201ENST00000440372 784 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
FXNQ16595 UBQLN1P1-207ENST00000441056 1169 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
FXNQ16595 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
FXNQ16595 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
FXNQ16595 RBMY2TP-201ENST00000451162 947 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AC108868.2-201ENST00000451464 511 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AC007879.2-201ENST00000454444 551 ntTSL 4 BASIC6.71□□□□□ -1.34
FXNQ16595 ETDA-202ENST00000454551 388 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
FXNQ16595 C1orf105-204ENST00000460397 462 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
FXNQ16595 RN7SL251P-201ENST00000464175 297 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
FXNQ16595 RN7SL414P-201ENST00000469545 294 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AC117386.1-201ENST00000474444 606 ntTSL 4 BASIC6.71□□□□□ -1.34
FXNQ16595 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
FXNQ16595 ALG13-214ENST00000482742 620 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AC104687.1-201ENST00000485829 412 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
FXNQ16595 OR2A20P-203ENST00000498397 1268 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AC106895.1-202ENST00000502956 777 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AC111193.1-201ENST00000504097 155 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
FXNQ16595 SUMO2P4-201ENST00000504193 276 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AC098487.1-204ENST00000506972 610 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AC108156.1-201ENST00000507849 481 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AC034206.1-201ENST00000509372 474 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AC097515.1-201ENST00000512370 435 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AC114801.1-201ENST00000512633 297 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
FXNQ16595 IGHVIII-38-1-201ENST00000521454 282 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
FXNQ16595 LINC00958-202ENST00000526388 607 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms