Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 MAGI2-AS3-210ENST00000448636 798 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 LINC01795-201ENST00000454367 813 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AC008280.2-201ENST00000455473 307 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 SRP68P2-201ENST00000456184 254 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 MED28P7-201ENST00000456611 530 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AL391863.1-202ENST00000457427 612 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 BX323845.2-201ENST00000458382 234 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 GAPDHP53-201ENST00000458397 924 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AP000805.1-201ENST00000471604 784 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AL132656.2-201ENST00000482985 1837 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 NDFIP2-203ENST00000487865 1384 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 MTCYBP35-201ENST00000503630 1137 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 GNPDA2-202ENST00000507534 1050 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 RNA5SP75-201ENST00000516841 111 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 KCNU1-202ENST00000518904 334 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 TPT1-AS1-206ENST00000519454 709 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 IGHVIII-25-1-201ENST00000522143 241 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AC090193.1-202ENST00000524355 566 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AP003110.1-201ENST00000526976 717 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 HSP90AA2P-201ENST00000530115 2196 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AF235103.1-201ENST00000530223 439 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 EQTN-204ENST00000537675 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AC005833.3-202ENST00000544741 770 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 LINC02451-202ENST00000548764 579 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AC092376.1-201ENST00000569677 335 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 C15orf65-201ENST00000569691 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AC138207.8-206ENST00000580053 637 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AC100844.1-201ENST00000580622 440 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AC005208.1-202ENST00000587325 725 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 PCAT19-201ENST00000588495 3472 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AC012370.2-201ENST00000597541 1080 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AL356056.3-201ENST00000605984 551 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 C1orf185-204ENST00000612209 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 GPR1-209ENST00000612892 2565 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 MIR663AHG-237ENST00000615682 1030 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AC243829.2-201ENST00000617914 470 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 KIAA1524-207ENST00000619684 2839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AP000432.2-201ENST00000624164 2048 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AC092451.3-201ENST00000625067 1343 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 RBMS3-AS2-206ENST00000629296 438 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 SATB1-AS1-259ENST00000629477 853 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AC243725.1-201ENST00000637164 436 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AP001153.1-201ENST00000641024 338 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 PDE4B-203ENST00000371045 3982 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 ATP2C1-203ENST00000422190 3386 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 CHD2-215ENST00000628375 3202 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 USP16-203ENST00000399975 2960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 MRE11-204ENST00000407439 2684 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 CREM-217ENST00000439705 2306 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 ARHGEF3-214ENST00000497267 2197 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 OR8B8-202ENST00000642064 3914 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 OR2L13-203ENST00000641893 1817 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 KARSP1-201ENST00000451871 1752 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 MIR4500HG-201ENST00000436290 1675 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AC129502.1-201ENST00000623261 1654 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 CDY19P-201ENST00000411668 1613 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 CDY18P-201ENST00000438294 1609 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 C8orf34-AS1-201ENST00000512294 1600 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 DCN-218ENST00000551354 2924 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 SSH1-202ENST00000326495 13040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 GRAMD2B-202ENST00000502348 1363 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 MGP-201ENST00000228938 694 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 RNA5SP280-201ENST00000411230 115 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AL359636.2-201ENST00000412262 259 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AL139135.1-201ENST00000412675 209 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 MICG-208ENST00000416822 132 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AL359382.1-201ENST00000417838 426 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 C7orf69-201ENST00000418326 675 ntTSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 PPIAP23-201ENST00000420099 497 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AL034379.1-201ENST00000423216 253 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 GAPDHP69-201ENST00000425504 1008 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AL645936.2-201ENST00000430565 928 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 SDHC-204ENST00000432287 460 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 MIR181A1HG-202ENST00000432296 930 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AC211433.1-202ENST00000434256 1187 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 LINC01393-202ENST00000435981 1187 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AL158214.1-201ENST00000444423 404 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 LINC00448-202ENST00000448411 433 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 ST13P21-201ENST00000453250 1098 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AC010878.1-201ENST00000456500 1047 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 ST20-201ENST00000478497 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 PLGLA-202ENST00000482249 475 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 RPL21P42-201ENST00000488408 464 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 MTND4LP2-201ENST00000502312 285 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 NPM1P27-201ENST00000502784 830 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AC105391.1-201ENST00000503155 1045 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.2 ms