Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AL662889.1-201ENST00000453572 389 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 AC073486.1-202ENST00000458437 489 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 AC114728.1-201ENST00000488289 483 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 AC025187.1-201ENST00000506305 686 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 ERVH-1-201ENST00000507666 639 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 AC021180.1-201ENST00000508581 558 ntTSL 4 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 AC124069.1-201ENST00000517454 735 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 AC025031.1-201ENST00000552634 562 ntTSL 4 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 AC103996.3-201ENST00000553477 442 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
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TCIRG1Q13488 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 AL354733.2-210ENST00000586211 647 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 AC008750.7-201ENST00000600765 559 ntTSL 4 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 AC110792.4-201ENST00000609843 298 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 AL161457.2-201ENST00000629181 630 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 OR51I2-202ENST00000641930 3302 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 ZNF106-201ENST00000263805 10460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 AC105105.2-201ENST00000590797 4521 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 TNRC6A-202ENST00000395799 8438 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
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TCIRG1Q13488 MEF2C-210ENST00000506554 3469 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 CEP250-202ENST00000397527 15703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 ARHGAP29-201ENST00000260526 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
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TCIRG1Q13488 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 STT3A-214ENST00000531491 2160 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 BDNF-203ENST00000395978 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 AC096921.2-201ENST00000561507 1916 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 UNC13B-209ENST00000635942 14550 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 AC107067.1-201ENST00000500009 1654 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 SUN3-203ENST00000412142 1448 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 CASC19-255ENST00000641733 1385 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 RPGRIP1L-206ENST00000564374 3877 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
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TCIRG1Q13488 DZIP3-201ENST00000361582 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 AC090518.1-201ENST00000562300 1495 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 VDAC3-201ENST00000022615 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 NAP1L1-227ENST00000618691 13505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
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TCIRG1Q13488 ARL4A-205ENST00000404894 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 AC063965.1-201ENST00000416679 499 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
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TCIRG1Q13488 MTND4P15-201ENST00000437913 1033 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 AL445238.1-201ENST00000450029 712 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 MTND6P32-201ENST00000457611 483 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 AC110749.1-201ENST00000462007 357 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 AC023245.1-201ENST00000468501 517 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 ATG10-AS1-201ENST00000504846 648 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 AC008945.1-201ENST00000505144 499 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 HAUS1P1-201ENST00000505275 832 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
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