Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 AL162464.1-201ENST00000557642 554 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 AC092121.1-201ENST00000569452 202 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 AC127024.4-201ENST00000585212 308 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 MRO-208ENST00000588444 866 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 AC243967.1-201ENST00000598976 578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 ZNF814-214ENST00000600634 461 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 AL138960.1-201ENST00000613838 513 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 AL353684.1-201ENST00000622677 1120 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 AL139220.2-221ENST00000628123 395 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 OR51Q1-202ENST00000641085 1096 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 BIN2P1-201ENST00000504996 1530 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 SLC35F1-202ENST00000621341 4481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 IL23R-201ENST00000347310 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 CHD6-202ENST00000373222 2477 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 ZNF735-201ENST00000429565 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 RNF19BPY-201ENST00000458209 1550 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 TM4SF20-201ENST00000304568 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 ZEB2-244ENST00000638007 9140 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 UGT2B15-201ENST00000338206 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 FGF1-216ENST00000621536 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 SLC9A6-212ENST00000637195 4858 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 CXCL8-201ENST00000307407 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 TRPM6-202ENST00000360774 8425 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 AC007114.2-201ENST00000576014 4281 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 BPESC1-201ENST00000418282 3522 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 LINC00630-201ENST00000416381 2012 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 TMSB4XP2-201ENST00000335179 210 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 RPL34P27-201ENST00000428810 349 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 AL021408.1-201ENST00000430428 552 ntTSL 4 BASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 NPM1P48-201ENST00000436002 853 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 AL583854.1-201ENST00000438818 613 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 LINC01891-201ENST00000439798 538 ntTSL 4 BASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 LINC01133-202ENST00000443364 1266 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 AL136982.3-201ENST00000454709 688 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 AC246785.3-201ENST00000455105 314 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 AL022319.1-201ENST00000458183 1167 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 SLC25A51P1-201ENST00000468432 871 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 RN7SL284P-201ENST00000498823 275 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 AC010260.1-201ENST00000511484 664 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 LINC02278-201ENST00000512170 500 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 AC018607.1-201ENST00000518552 673 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 AC008429.4-201ENST00000521201 182 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 AP000424.2-201ENST00000523784 233 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 MITF-217ENST00000531774 1074 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 AC009509.1-201ENST00000536317 1110 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 LDHC-205ENST00000537486 583 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 AP003037.1-201ENST00000537594 267 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 AC090236.2-201ENST00000587933 1101 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 FAM72A-208ENST00000607379 1139 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 AC004921.1-201ENST00000608884 733 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 AC108673.3-201ENST00000609183 335 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 AP000904.1-201ENST00000609911 951 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 AC010998.3-201ENST00000613871 631 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 ATP13A5-205ENST00000620313 709 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 AC020763.5-201ENST00000623298 430 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 OXSM-209ENST00000626005 309 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 AC012564.1-201ENST00000636802 557 ntTSL 4 BASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 5S_rRNA.28-201ENST00000638107 119 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 PCDH18-202ENST00000412923 5102 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 NLGN1-202ENST00000401917 1827 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 NAT2-201ENST00000286479 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 IMMTP1-201ENST00000435590 2219 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 LRRN3-201ENST00000308478 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 VEPH1-205ENST00000468233 1401 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 FAM197Y8-201ENST00000426661 2340 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 WDYHV1-208ENST00000523984 1491 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 PDE4D-226ENST00000546160 7690 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 DCX-207ENST00000635795 9163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 BDNF-217ENST00000533131 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 LINC01297-204ENST00000621052 4222 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 DAZ2-204ENST00000382431 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 KLHL4-201ENST00000373114 2445 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 AOX3P-204ENST00000491025 2107 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 AL606516.1-201ENST00000455438 1861 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 RNFT1P3-201ENST00000340898 1052 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 CEACAM7-202ENST00000401731 1236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 AL132875.1-201ENST00000403623 949 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 TEX50-201ENST00000417563 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 LDHAP2-201ENST00000437325 985 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 C21orf91-OT1-203ENST00000439392 497 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 AL355390.2-201ENST00000446691 880 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 AP002371.1-201ENST00000463604 433 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 RN7SL717P-201ENST00000478343 297 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 SERF1B-203ENST00000503931 569 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 SERF1A-204ENST00000504458 569 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms