Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 NPIPA2-203ENST00000553201 1053 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 AC007346.1-201ENST00000569208 867 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 ZNF174-204ENST00000572544 1002 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 AC127540.1-201ENST00000580311 689 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 AL132656.2-201ENST00000482985 1837 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 PSG10P-201ENST00000501199 1500 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 RANBP3L-204ENST00000515759 1532 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 AL161756.3-201ENST00000641216 2071 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 SOAT1-201ENST00000367619 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 ZNF26-202ENST00000534834 4853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 ING3-204ENST00000431467 1447 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 DOCK9-208ENST00000448493 7887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 PPBPP2-201ENST00000513150 1362 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 CASP5-208ENST00000526056 1344 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 DAAM1-202ENST00000395125 5806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 P2RY14-202ENST00000424796 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 LRRC37A3-202ENST00000334962 2654 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 RN7SKP128-201ENST00000364270 303 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 DAOA-202ENST00000375936 742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 DEFB126-201ENST00000382398 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 TRAV1-2-201ENST00000390423 402 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 GLS-203ENST00000409215 632 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 AL359885.1-201ENST00000415786 903 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 XIST-201ENST00000416330 750 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 AL590399.2-201ENST00000427536 309 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 HTR5BP-202ENST00000434708 1193 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 AL353662.1-201ENST00000439099 327 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 AC097463.1-201ENST00000447288 481 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 AC000124.1-201ENST00000448311 957 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 AL590399.3-202ENST00000448491 495 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 HMGB1P7-201ENST00000450921 612 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 AC011405.1-202ENST00000504658 803 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 AC008448.1-201ENST00000505109 584 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 AC108103.1-201ENST00000511286 446 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 IGKV2-19-201ENST00000518132 283 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 OR56A7P-201ENST00000524865 941 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 OR52B2-201ENST00000530810 1079 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 AC089998.2-201ENST00000551856 277 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 AC073964.1-201ENST00000558938 308 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 INO80-AS1-201ENST00000558967 312 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 AC087392.1-201ENST00000576252 820 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 FAM60CP-201ENST00000591086 664 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 AC243967.1-201ENST00000598976 578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 AL589745.2-201ENST00000616366 555 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 MALAT1-214ENST00000618925 424 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 AJ009632.2-209ENST00000634853 933 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 AC008163.1-201ENST00000636281 1455 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 ST7-203ENST00000393443 2360 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 ZNF610-202ENST00000327920 1855 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 MEIS1-201ENST00000272369 4291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 SPRY3-201ENST00000302805 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 ICE2P1-201ENST00000512800 1849 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 HSFY1P1-202ENST00000425038 1381 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 RSU1P2-203ENST00000448600 1582 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 MED12L-206ENST00000474524 10744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 ECT2L-205ENST00000541398 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 ALG11-202ENST00000521508 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 KYNUP3-201ENST00000574386 1341 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 AC090181.3-201ENST00000624777 1514 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 AC008627.1-201ENST00000517511 1704 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 NUMB-201ENST00000355058 3342 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 MEF2C-249ENST00000637481 6088 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 CYLD-207ENST00000564326 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 LINC01375-201ENST00000428485 1860 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 MSL3P1-202ENST00000440028 1468 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 PLSCR2-201ENST00000336685 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 SNORA51.9-201ENST00000384295 124 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 MIR130B-202ENST00000385018 82 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 AL607077.1-201ENST00000401718 499 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 AL109610.1-201ENST00000414598 431 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 RPS7P8-201ENST00000418311 581 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 AL121885.3-201ENST00000422833 115 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 MTCO1P57-201ENST00000432182 261 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 AC073062.1-201ENST00000434509 455 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 PNKDP1-201ENST00000435914 430 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 AC096632.2-201ENST00000438139 1239 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 OSTCP1-201ENST00000455507 450 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 AC104164.1-201ENST00000460282 590 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 RN7SL269P-201ENST00000467795 305 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 AL158068.1-201ENST00000506116 616 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 AC096576.2-201ENST00000511835 948 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.6 ms