Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 AL355974.3-201ENST00000617383 467 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 FO681491.1-202ENST00000623392 737 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 AC129778.1-202ENST00000623812 261 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 AL591379.1-207ENST00000635982 261 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 AMYH02020865.1-205ENST00000636189 261 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 GCSAML-210ENST00000536561 4063 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 FGG-201ENST00000336098 1659 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 FCGR3B-208ENST00000613418 2251 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 DDAH1-204ENST00000535924 3909 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 PSG7-206ENST00000623675 1392 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 GVINP1-201ENST00000526769 8438 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 BPY2-201ENST00000331070 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 KIF16B-202ENST00000355755 606 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 BPY2C-201ENST00000382287 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 BPY2B-201ENST00000382392 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 CYP2AC1P-201ENST00000407830 1173 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 AL162430.2-201ENST00000422306 435 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 PCBP2P1-201ENST00000437262 977 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 VN1R110P-201ENST00000438988 971 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 AL138899.2-201ENST00000439139 499 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 MEOX2-AS1-201ENST00000442176 697 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 RPL5P10-201ENST00000445207 894 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 AC132807.1-201ENST00000449613 458 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 AL359839.1-201ENST00000451975 1160 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 ACA64.1-201ENST00000459171 127 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 GCSAM-204ENST00000484193 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 AC011396.3-201ENST00000508845 512 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 AC006499.4-201ENST00000510947 694 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 AC097537.1-201ENST00000514864 1213 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 AC090103.1-201ENST00000520386 485 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
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FOXF1Q12946 PCNAP4-201ENST00000532690 730 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 AL157756.1-203ENST00000553269 600 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 AC018558.1-201ENST00000562591 459 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
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FOXF1Q12946 AC022211.1-201ENST00000579554 717 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
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FOXF1Q12946 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 PKIB-207ENST00000392491 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
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FOXF1Q12946 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
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FOXF1Q12946 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 CRYGS-201ENST00000307944 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
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FOXF1Q12946 RPS24-201ENST00000360830 514 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 RAB5CP1-201ENST00000395972 580 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
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FOXF1Q12946 FO393401.1-203ENST00000416260 486 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 AL353608.2-201ENST00000425587 340 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 BX323845.3-201ENST00000428215 527 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 AL121917.1-201ENST00000441270 893 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 MIS18A-AS1-201ENST00000453549 769 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 SELENOT-204ENST00000480740 783 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 AC010181.1-202ENST00000509191 798 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 HAND2-AS1-235ENST00000515376 951 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 AC008680.1-201ENST00000523398 283 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 AP000424.2-201ENST00000523784 233 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 CREBZF-209ENST00000534224 545 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 OTX2-203ENST00000554559 715 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 AC006530.1-201ENST00000555980 571 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 AC079298.3-201ENST00000624941 977 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 FP236241.1-206ENST00000625005 987 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 MTRNR2L3-201ENST00000543500 1539 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 EIF3EP2-201ENST00000423042 1814 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 AL592429.1-201ENST00000403909 1473 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 OR52N5-202ENST00000641181 2778 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
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