Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 GPRC5D-AS1-205ENST00000540198 404 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 ZNF322P1-201ENST00000568013 1209 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 ZNF566-204ENST00000434377 5197 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 ZNF207-207ENST00000577908 4672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 LINC01793-201ENST00000409590 2036 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 KLHL3-209ENST00000508657 6981 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 KCNMB3-205ENST00000485523 7246 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 PRLR-203ENST00000348262 1339 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 METTL2B-204ENST00000480046 5743 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 ART4-201ENST00000228936 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 RN7SKP128-201ENST00000364270 303 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 AC244035.2-201ENST00000425896 630 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 CFL1P1-202ENST00000432948 411 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 CUBNP2-201ENST00000443534 1139 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 AC007370.1-201ENST00000503163 316 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 LINC01966-201ENST00000595809 821 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 ELSPBP1-206ENST00000619003 893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 CU639417.4-201ENST00000623928 207 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 DARS-AS1-227ENST00000627442 633 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 FAM205A-201ENST00000378788 4225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 LRBA-209ENST00000510413 10032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 ADGRE1-202ENST00000312053 3128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 TACC1-207ENST00000519416 5510 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 TACC1-210ENST00000520615 5509 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 NBPF11-202ENST00000614015 4630 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 RN7SKP125-201ENST00000410481 302 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 AL391704.3-201ENST00000425365 831 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 AC024558.1-201ENST00000505008 528 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 BX510359.5-201ENST00000515651 304 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 AC113386.1-201ENST00000523584 381 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 OR4A42P-201ENST00000531397 938 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 AC007346.2-201ENST00000564816 892 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 AL589935.1-223ENST00000587015 808 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 TXK-201ENST00000264316 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 MAPK10-270ENST00000641102 3538 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 PYROXD1-205ENST00000538582 3639 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 ZNF254-206ENST00000611359 3982 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 PTPRB-204ENST00000538708 5839 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 PTPRB-209ENST00000550857 5839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 ST6GAL1-211ENST00000448044 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 CD96-201ENST00000283285 4324 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 HGF-205ENST00000423064 1990 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 SEPT14P12-201ENST00000442280 560 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 GYG1P1-201ENST00000460864 698 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 AC004453.1-201ENST00000487895 408 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 LINC02492-201ENST00000502952 564 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 AC013644.1-201ENST00000523724 555 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 AC211433.1-206ENST00000595409 733 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 SEC23IP-201ENST00000369075 7168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 DCP2-208ENST00000515408 8029 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 PLXNA4-201ENST00000321063 13061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 SERPINA9-204ENST00000424550 1462 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 HIPK1-201ENST00000340480 6997 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 CTNND1-206ENST00000415361 5832 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 CTNND1-225ENST00000530094 5814 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 FBXW12-201ENST00000296438 1647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 LRBA-204ENST00000507224 8826 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 RPL35AP24-201ENST00000413846 330 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 AL022329.1-203ENST00000453811 451 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 ST20-201ENST00000478497 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 PRELID3BP5-201ENST00000508612 460 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 AC090424.1-201ENST00000535243 736 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 AC136944.1-201ENST00000567464 560 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 AC098617.1-205ENST00000595918 1032 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 AC012593.1-212ENST00000627058 580 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 ALMS1-206ENST00000613296 12925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 APELA-202ENST00000507152 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 TOR1AIP1-202ENST00000435319 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 LINC01630-208ENST00000635680 4363 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
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