Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RIPPLY1Q0D2K3 OR12D2-207ENST00000642051 1496 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RIPPLY1Q0D2K3 SLC10A7-204ENST00000502607 1638 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
RIPPLY1Q0D2K3 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
RIPPLY1Q0D2K3 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
RIPPLY1Q0D2K3 FAR2-201ENST00000182377 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
RIPPLY1Q0D2K3 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
RIPPLY1Q0D2K3 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RIPPLY1Q0D2K3 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RIPPLY1Q0D2K3 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
RIPPLY1Q0D2K3 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
RIPPLY1Q0D2K3 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
RIPPLY1Q0D2K3 FAM114A2-201ENST00000351797 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
RIPPLY1Q0D2K3 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RIPPLY1Q0D2K3 METTL6-203ENST00000443029 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RIPPLY1Q0D2K3 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
RIPPLY1Q0D2K3 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
RIPPLY1Q0D2K3 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RIPPLY1Q0D2K3 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RIPPLY1Q0D2K3 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RIPPLY1Q0D2K3 RPL17-C18orf32-203ENST00000584895 1440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RIPPLY1Q0D2K3 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
RIPPLY1Q0D2K3 OFD1P15Y-201ENST00000411536 1392 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RIPPLY1Q0D2K3 TRIM51-201ENST00000244891 1329 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
RIPPLY1Q0D2K3 OR4Q3-201ENST00000331723 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RIPPLY1Q0D2K3 SNORA43.1-201ENST00000364863 140 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RIPPLY1Q0D2K3 AC003045.1-201ENST00000398779 713 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RIPPLY1Q0D2K3 RN7SKP121-201ENST00000410842 305 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RIPPLY1Q0D2K3 AL138828.1-204ENST00000413745 898 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RIPPLY1Q0D2K3 DHFRP2-201ENST00000414224 547 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RIPPLY1Q0D2K3 AC016582.1-203ENST00000433142 502 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RIPPLY1Q0D2K3 AC128677.1-201ENST00000436016 442 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RIPPLY1Q0D2K3 AL731544.1-201ENST00000436500 370 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RIPPLY1Q0D2K3 CRYZL1-217ENST00000445393 824 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RIPPLY1Q0D2K3 AC104457.2-201ENST00000446055 467 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RIPPLY1Q0D2K3 COX4I1P2-201ENST00000447446 547 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RIPPLY1Q0D2K3 AC005518.1-201ENST00000448131 1116 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RIPPLY1Q0D2K3 AL031275.1-201ENST00000457405 418 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RIPPLY1Q0D2K3 AC018980.1-201ENST00000457848 862 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RIPPLY1Q0D2K3 RN7SL39P-201ENST00000462264 297 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RIPPLY1Q0D2K3 RN7SL352P-201ENST00000466002 277 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RIPPLY1Q0D2K3 SEPT7P9-201ENST00000475691 413 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
RIPPLY1Q0D2K3 AC135999.1-201ENST00000478962 479 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RIPPLY1Q0D2K3 AC004594.1-201ENST00000482375 463 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RIPPLY1Q0D2K3 MBNL1-217ENST00000485509 1023 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
RIPPLY1Q0D2K3 MBNL1-219ENST00000492948 1054 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
RIPPLY1Q0D2K3 AC023794.2-201ENST00000504891 528 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RIPPLY1Q0D2K3 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RIPPLY1Q0D2K3 AC131094.1-201ENST00000506984 490 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RIPPLY1Q0D2K3 OR4D12P-201ENST00000509361 911 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RIPPLY1Q0D2K3 AL035458.2-201ENST00000512005 478 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RIPPLY1Q0D2K3 AP001085.1-201ENST00000524441 639 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RIPPLY1Q0D2K3 AC092865.1-201ENST00000544395 1023 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RIPPLY1Q0D2K3 LINC01895-201ENST00000558690 404 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RIPPLY1Q0D2K3 AC073964.1-201ENST00000558938 308 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RIPPLY1Q0D2K3 AC009117.3-202ENST00000563825 557 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RIPPLY1Q0D2K3 AC026462.3-201ENST00000565153 557 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RIPPLY1Q0D2K3 MIR212-201ENST00000586026 110 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RIPPLY1Q0D2K3 AC020916.2-201ENST00000591242 360 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RIPPLY1Q0D2K3 AC107993.1-201ENST00000591343 684 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RIPPLY1Q0D2K3 AC020915.3-201ENST00000595301 550 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RIPPLY1Q0D2K3 COX6CP7-201ENST00000597056 208 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RIPPLY1Q0D2K3 AC004890.3-201ENST00000605566 1095 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RIPPLY1Q0D2K3 AC068726.1-201ENST00000610993 341 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RIPPLY1Q0D2K3 AC007786.3-201ENST00000615154 596 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RIPPLY1Q0D2K3 Metazoa_SRP.77-201ENST00000616915 252 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RIPPLY1Q0D2K3 TEX41-279ENST00000629149 609 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RIPPLY1Q0D2K3 AC134980.1-214ENST00000638815 687 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RIPPLY1Q0D2K3 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RIPPLY1Q0D2K3 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RIPPLY1Q0D2K3 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RIPPLY1Q0D2K3 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
RIPPLY1Q0D2K3 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RIPPLY1Q0D2K3 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
RIPPLY1Q0D2K3 MSR1-204ENST00000381998 2826 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF610-208ENST00000613461 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
RIPPLY1Q0D2K3 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
RIPPLY1Q0D2K3 RAB30-214ENST00000534141 3746 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
RIPPLY1Q0D2K3 GABRA2-205ENST00000507069 1562 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RIPPLY1Q0D2K3 AC068870.3-201ENST00000625077 2536 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RIPPLY1Q0D2K3 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
RIPPLY1Q0D2K3 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RIPPLY1Q0D2K3 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
RIPPLY1Q0D2K3 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RIPPLY1Q0D2K3 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RIPPLY1Q0D2K3 GNRHR-201ENST00000226413 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
RIPPLY1Q0D2K3 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RIPPLY1Q0D2K3 SPRR2B-201ENST00000368755 617 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RIPPLY1Q0D2K3 TRAV10-201ENST00000390432 379 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RIPPLY1Q0D2K3 YWHAZP4-201ENST00000392459 708 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RIPPLY1Q0D2K3 MORN2-202ENST00000409077 465 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RIPPLY1Q0D2K3 AC104463.1-201ENST00000411431 365 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RIPPLY1Q0D2K3 AP006748.1-201ENST00000418874 346 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RIPPLY1Q0D2K3 OSTCP4-201ENST00000424397 449 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RIPPLY1Q0D2K3 QKI-206ENST00000424802 954 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
RIPPLY1Q0D2K3 RPS7P14-201ENST00000426405 583 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RIPPLY1Q0D2K3 AC093151.2-201ENST00000429109 394 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RIPPLY1Q0D2K3 LINC01372-201ENST00000430244 489 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
RIPPLY1Q0D2K3 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RIPPLY1Q0D2K3 IGLV3-4-201ENST00000432300 244 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms