Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 EIF4EBP2P1-201ENST00000450009 343 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
PTPRGP23470 CYP4F62P-203ENST00000455215 552 ntTSL 4 BASIC9.12□□□□□ -0.95
PTPRGP23470 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC9.12□□□□□ -0.95
PTPRGP23470 RPEP1-201ENST00000504507 658 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
PTPRGP23470 AC131953.1-201ENST00000513127 477 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
PTPRGP23470 LINC02234-202ENST00000513288 705 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
PTPRGP23470 AP005209.1-201ENST00000582531 928 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
PTPRGP23470 TAS2R6P-201ENST00000605022 826 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
PTPRGP23470 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
PTPRGP23470 AL445528.2-201ENST00000620582 470 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
PTPRGP23470 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
PTPRGP23470 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PTPRGP23470 AL512634.1-201ENST00000566873 2432 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PTPRGP23470 CAPRIN1-209ENST00000530820 3454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
PTPRGP23470 IFRD1-216ENST00000535603 3397 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
PTPRGP23470 AC022905.1-201ENST00000503430 3048 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
PTPRGP23470 AC087516.2-201ENST00000558963 3042 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
PTPRGP23470 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
PTPRGP23470 IGF1R-206ENST00000558762 11726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
PTPRGP23470 AL359551.1-201ENST00000442726 2900 ntTSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
PTPRGP23470 PHEX-AS1-201ENST00000424650 1906 ntTSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
PTPRGP23470 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
PTPRGP23470 LINC01505-205ENST00000636028 2298 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
PTPRGP23470 THRB-202ENST00000356447 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
PTPRGP23470 MID1-202ENST00000380779 6044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
PTPRGP23470 OR8I2-201ENST00000302124 1010 ntAPPRIS P1 BASIC9.11□□□□□ -0.95
PTPRGP23470 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
PTPRGP23470 RNU1-24P-201ENST00000364285 165 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
PTPRGP23470 TSACC-201ENST00000368251 438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
PTPRGP23470 SPANXN1-201ENST00000370493 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
PTPRGP23470 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC9.11□□□□□ -0.95
PTPRGP23470 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC9.11□□□□□ -0.95
PTPRGP23470 AZGP1P2-201ENST00000454506 345 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
PTPRGP23470 AC103563.5-201ENST00000455643 364 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
PTPRGP23470 RN7SL352P-201ENST00000466002 277 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
PTPRGP23470 RPL38P3-201ENST00000484463 213 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
PTPRGP23470 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
PTPRGP23470 GSTP1P1-201ENST00000548078 319 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
PTPRGP23470 LINC00871-204ENST00000556886 866 ntTSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
PTPRGP23470 AC026992.2-201ENST00000570122 766 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
PTPRGP23470 AC114684.1-201ENST00000587659 352 ntTSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
PTPRGP23470 AC098617.1-205ENST00000595918 1032 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
PTPRGP23470 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
PTPRGP23470 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
PTPRGP23470 ABL2-201ENST00000344730 6910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
PTPRGP23470 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
PTPRGP23470 SSR1-201ENST00000244763 9669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
PTPRGP23470 RUNX1T1-205ENST00000436581 7454 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
PTPRGP23470 LINC01361-202ENST00000452834 1526 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PTPRGP23470 TLR4-201ENST00000355622 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PTPRGP23470 PTPN14-201ENST00000366956 12985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PTPRGP23470 IL22RA2-203ENST00000349184 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PTPRGP23470 MTURN-202ENST00000324489 5605 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PTPRGP23470 AC127070.3-201ENST00000503695 3263 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
PTPRGP23470 SIAH3-201ENST00000400405 7057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PTPRGP23470 SLC16A4-201ENST00000369779 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PTPRGP23470 AC068189.1-201ENST00000501164 2632 ntTSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
PTPRGP23470 AC019205.1-201ENST00000421830 730 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
PTPRGP23470 PA2G4P6-201ENST00000438325 1197 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
PTPRGP23470 AF181450.1-201ENST00000522980 410 ntTSL 3 BASIC9.1□□□□□ -0.95
PTPRGP23470 PWRN4-201ENST00000563016 420 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
PTPRGP23470 AL589935.1-223ENST00000587015 808 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
PTPRGP23470 AC007620.2-201ENST00000600539 1697 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
PTPRGP23470 CLTC-201ENST00000269122 7760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PTPRGP23470 ZFHX4-204ENST00000518282 12175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
PTPRGP23470 FCGR1B-209ENST00000616817 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
PTPRGP23470 CNTRL-207ENST00000373855 7660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
PTPRGP23470 AMOT-201ENST00000304758 6888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PTPRGP23470 ADCY10-205ENST00000545172 4966 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
PTPRGP23470 INTS2-207ENST00000617492 5805 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
PTPRGP23470 PDZRN4-201ENST00000298919 3411 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
PTPRGP23470 AC018765.1-201ENST00000623357 3446 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
PTPRGP23470 ATOX1-203ENST00000521264 4341 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
PTPRGP23470 HMCN2-206ENST00000624552 15610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
PTPRGP23470 ZNF83-205ENST00000594682 2890 ntTSL 4 BASIC9.09□□□□□ -0.95
PTPRGP23470 TAS2R31-201ENST00000390675 1021 ntAPPRIS P1 BASIC9.09□□□□□ -0.95
PTPRGP23470 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
PTPRGP23470 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
PTPRGP23470 AC244394.2-201ENST00000425109 735 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
PTPRGP23470 AL731661.2-201ENST00000448824 806 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PTPRGP23470 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
PTPRGP23470 AC093890.1-201ENST00000502554 540 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
PTPRGP23470 AC097515.1-202ENST00000511818 371 ntTSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
PTPRGP23470 UQCRB-209ENST00000523920 695 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
PTPRGP23470 AP001922.4-201ENST00000526967 290 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
PTPRGP23470 AP002505.2-201ENST00000623585 696 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
PTPRGP23470 SETDB1-201ENST00000271640 4437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PTPRGP23470 SLC23A2-202ENST00000379333 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PTPRGP23470 FBXW7-203ENST00000296555 3572 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PTPRGP23470 ZNF91-202ENST00000397082 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
PTPRGP23470 AP2B1-215ENST00000616681 3267 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
PTPRGP23470 TESPA1-212ENST00000532804 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
PTPRGP23470 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PTPRGP23470 GPN1-203ENST00000424214 1725 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
PTPRGP23470 OR7D4-203ENST00000641669 4965 ntAPPRIS P1 BASIC9.09□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 OLFM3-202ENST00000370103 3255 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 KIAA0232-201ENST00000307659 7841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 MME-203ENST00000460393 5622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 AOX3P-204ENST00000491025 2107 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.6 ms