Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 YWHAZP4-201ENST00000392459 708 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 YWHAZP6-201ENST00000399764 738 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 AC098872.1-201ENST00000413304 543 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 AC104389.1-201ENST00000418080 522 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 QKI-206ENST00000424802 954 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 AL356309.1-201ENST00000425153 339 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 AC012668.2-201ENST00000431727 503 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 ELOCP8-201ENST00000439309 332 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 EIF5AP4-201ENST00000441206 465 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 ELOCP15-201ENST00000442090 332 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 AL357052.1-201ENST00000443504 381 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 AC068135.1-201ENST00000446164 246 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 RPL31P20-201ENST00000449593 360 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 RN7SL552P-201ENST00000462094 276 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 AC055733.3-201ENST00000505214 523 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 AC092903.2-201ENST00000510244 427 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 AC138938.1-201ENST00000515431 782 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 RNA5SP441-201ENST00000516809 88 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 AC023202.1-201ENST00000521681 491 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 LINC00944-204ENST00000544499 366 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 AC020612.3-201ENST00000550644 570 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 PCNPP1-201ENST00000552501 511 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 ULK4P1-202ENST00000565174 503 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 AC022069.1-201ENST00000582910 658 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 AC104996.1-201ENST00000583250 591 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 AC015802.2-201ENST00000589690 189 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 ZRANB2-AS2-212ENST00000590186 686 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 AC079315.1-201ENST00000602952 623 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 AL031601.1-201ENST00000605702 394 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 AC026786.2-201ENST00000606110 392 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 AC097376.2-202ENST00000608345 433 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 AL450489.1-201ENST00000612071 468 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 OSTC-205ENST00000613215 876 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 AC025588.4-201ENST00000615802 908 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 AC092329.4-204ENST00000639327 549 ntTSL 4 BASIC7.85□□□□□ -1.15
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PTPRAP18433 AL596275.2-203ENST00000641951 371 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 KIF1B-203ENST00000377083 5885 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 SPATA31C2-201ENST00000324915 3777 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 AP1G1-201ENST00000299980 6969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 EIF4E2-207ENST00000409514 3525 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 GSDMB-202ENST00000360317 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
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PTPRAP18433 ZMYND8-211ENST00000446994 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 AC112719.2-201ENST00000501239 1685 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
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PTPRAP18433 ZFYVE9-204ENST00000371591 4874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 EFCAB6-203ENST00000396231 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
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PTPRAP18433 CD109-203ENST00000437994 9401 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 NXPE3-203ENST00000477909 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 RNU6-304P-201ENST00000364855 107 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
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PTPRAP18433 AL158825.1-201ENST00000414735 521 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 RPL6-202ENST00000424576 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 AC124944.2-201ENST00000429866 1242 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
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PTPRAP18433 AC104779.1-201ENST00000503557 441 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 LINC02147-201ENST00000509367 807 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 AC012055.1-201ENST00000511346 1144 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 DEFB134-202ENST00000526438 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 AC022240.1-201ENST00000532065 684 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 TMEM106C-215ENST00000550552 776 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 AL049836.2-201ENST00000553318 513 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 AC009852.1-201ENST00000564058 465 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
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