Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 AL138789.1-201ENST00000425820 960 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 AC018467.1-202ENST00000432612 533 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 AC094019.1-201ENST00000434678 472 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 DNAJC19P5-201ENST00000443295 316 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 CYP3A43-210ENST00000444905 733 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 RPL7P55-201ENST00000450522 746 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 AC135721.2-201ENST00000464237 300 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 OR2A1-AS1-202ENST00000467944 422 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 TSACC-207ENST00000470342 601 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 RPL23AP73-201ENST00000492507 471 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 FXN-205ENST00000498653 856 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 LINC01386-201ENST00000506196 440 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 AC097515.1-201ENST00000512370 435 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 SNHG27-203ENST00000514222 680 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 RN7SKP238-201ENST00000516483 249 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 AP001207.2-201ENST00000519490 539 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 ZFAND1-208ENST00000519523 698 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 OR4A21P-201ENST00000532759 944 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 LRRC37A5P-202ENST00000536054 1095 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 AC084816.1-202ENST00000536744 647 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 AC119044.1-202ENST00000548463 339 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 AL355075.3-201ENST00000554678 492 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 ASXL1-208ENST00000555343 1034 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 AC103740.1-202ENST00000558404 542 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 AC009097.1-201ENST00000567077 406 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 RN7SL475P-201ENST00000583379 298 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 AL157938.2-208ENST00000590461 877 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 KATNBL1P5-201ENST00000605015 517 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 AC112211.1-201ENST00000607832 305 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 AC004241.3-201ENST00000611728 517 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 OR4M2-201ENST00000614722 1133 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 ZNHIT3-208ENST00000619730 926 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 AC105105.5-201ENST00000622635 1294 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 AC003992.1-201ENST00000635364 557 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 LINC02495-203ENST00000636704 242 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 TNRC6A-201ENST00000315183 8303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 MEF2C-210ENST00000506554 3469 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 AL355306.2-201ENST00000635570 1542 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 CDH2-202ENST00000399380 3737 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 CACNB2-215ENST00000615785 3707 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 AP002026.1-201ENST00000500358 4825 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 EIF2A-202ENST00000406576 1795 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 PPP3R2-201ENST00000374806 3387 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 MAGT1-204ENST00000610432 4019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 CYP4Z2P-202ENST00000505841 1436 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 STT3A-214ENST00000531491 2160 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 CXCR6-204ENST00000458629 2805 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 IGSF11-201ENST00000354673 3206 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 OR52I1-202ENST00000530443 2961 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 BMPR2-202ENST00000374580 11461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 PHLDB2-202ENST00000393925 5543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 SEPT14-201ENST00000388975 3785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 PMFBP1-202ENST00000355636 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 FAM20A-207ENST00000619787 2798 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 TRIM5-203ENST00000396847 3170 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 POU2F3-201ENST00000260264 2903 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 ENTPD5-207ENST00000557325 3096 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 UGT3A1-207ENST00000625798 3097 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 AC005261.4-201ENST00000600047 1385 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 UTP15-201ENST00000296792 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 NXF2B-204ENST00000618302 2884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 DOCK11-201ENST00000276202 6625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 ZNF727-201ENST00000456806 1679 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.98□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 IFNK-201ENST00000276943 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 TENM4-201ENST00000278550 14000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 RNU4-28P-201ENST00000364739 141 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 SUGT1P2-201ENST00000379452 992 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 AP002784.2-201ENST00000397300 549 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 TOMM7-203ENST00000405021 455 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 PRELID1P2-201ENST00000407805 396 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 AL359382.1-201ENST00000417838 426 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 AL591468.1-201ENST00000417932 573 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 AL390036.1-201ENST00000419428 734 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 HMGN1P6-201ENST00000438508 291 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 MIR4432HG-201ENST00000441598 470 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 AC016772.1-201ENST00000444170 1261 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 KRTAP2-5P-201ENST00000446109 396 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 AC005772.1-201ENST00000446671 976 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 AL031313.1-201ENST00000448435 256 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 MORF4L1P4-201ENST00000450245 976 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 NPM1P13-201ENST00000452663 865 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 SBDSP1-204ENST00000453858 737 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 AC096922.1-201ENST00000461635 651 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 UBFD1P1-201ENST00000473259 814 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 AC126121.1-201ENST00000482313 553 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 L3HYPDH-206ENST00000487285 700 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 EIF1P7-201ENST00000487533 337 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 AC022784.1-201ENST00000512942 699 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 RNA5SP271-201ENST00000516700 88 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms