Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q9

NCOA3, Nuclear receptor coactivator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA3Q9Y6Q9 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NCOA3Q9Y6Q9 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
NCOA3Q9Y6Q9 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NCOA3Q9Y6Q9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NCOA3Q9Y6Q9 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NCOA3Q9Y6Q9 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NCOA3Q9Y6Q9 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NCOA3Q9Y6Q9 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NCOA3Q9Y6Q9 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
NCOA3Q9Y6Q9 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NCOA3Q9Y6Q9 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NCOA3Q9Y6Q9 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
NCOA3Q9Y6Q9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NCOA3Q9Y6Q9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NCOA3Q9Y6Q9 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NCOA3Q9Y6Q9 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NCOA3Q9Y6Q9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NCOA3Q9Y6Q9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NCOA3Q9Y6Q9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NCOA3Q9Y6Q9 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NCOA3Q9Y6Q9 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NCOA3Q9Y6Q9 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NCOA3Q9Y6Q9 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NCOA3Q9Y6Q9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NCOA3Q9Y6Q9 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NCOA3Q9Y6Q9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NCOA3Q9Y6Q9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NCOA3Q9Y6Q9 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NCOA3Q9Y6Q9 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NCOA3Q9Y6Q9 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NCOA3Q9Y6Q9 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NCOA3Q9Y6Q9 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NCOA3Q9Y6Q9 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NCOA3Q9Y6Q9 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NCOA3Q9Y6Q9 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NCOA3Q9Y6Q9 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NCOA3Q9Y6Q9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NCOA3Q9Y6Q9 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NCOA3Q9Y6Q9 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NCOA3Q9Y6Q9 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NCOA3Q9Y6Q9 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NCOA3Q9Y6Q9 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NCOA3Q9Y6Q9 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NCOA3Q9Y6Q9 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NCOA3Q9Y6Q9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NCOA3Q9Y6Q9 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NCOA3Q9Y6Q9 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NCOA3Q9Y6Q9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NCOA3Q9Y6Q9 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NCOA3Q9Y6Q9 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NCOA3Q9Y6Q9 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
NCOA3Q9Y6Q9 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NCOA3Q9Y6Q9 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NCOA3Q9Y6Q9 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NCOA3Q9Y6Q9 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
NCOA3Q9Y6Q9 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
NCOA3Q9Y6Q9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NCOA3Q9Y6Q9 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NCOA3Q9Y6Q9 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NCOA3Q9Y6Q9 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NCOA3Q9Y6Q9 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NCOA3Q9Y6Q9 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NCOA3Q9Y6Q9 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NCOA3Q9Y6Q9 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NCOA3Q9Y6Q9 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NCOA3Q9Y6Q9 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NCOA3Q9Y6Q9 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NCOA3Q9Y6Q9 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NCOA3Q9Y6Q9 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
NCOA3Q9Y6Q9 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NCOA3Q9Y6Q9 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
NCOA3Q9Y6Q9 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NCOA3Q9Y6Q9 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NCOA3Q9Y6Q9 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
NCOA3Q9Y6Q9 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NCOA3Q9Y6Q9 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NCOA3Q9Y6Q9 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NCOA3Q9Y6Q9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NCOA3Q9Y6Q9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NCOA3Q9Y6Q9 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NCOA3Q9Y6Q9 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NCOA3Q9Y6Q9 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NCOA3Q9Y6Q9 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCOA3Q9Y6Q9 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCOA3Q9Y6Q9 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCOA3Q9Y6Q9 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCOA3Q9Y6Q9 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCOA3Q9Y6Q9 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NCOA3Q9Y6Q9 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCOA3Q9Y6Q9 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCOA3Q9Y6Q9 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCOA3Q9Y6Q9 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCOA3Q9Y6Q9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCOA3Q9Y6Q9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCOA3Q9Y6Q9 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCOA3Q9Y6Q9 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCOA3Q9Y6Q9 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCOA3Q9Y6Q9 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCOA3Q9Y6Q9 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCOA3Q9Y6Q9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms