Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms