Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD1Q9GZZ0 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
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