Protein–RNA interactions for Protein: Q96FC9

DDX11, ATP-dependent DNA helicase DDX11, humanhuman

Predictions only

Length 970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX11Q96FC9 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms