Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms