Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rph3alQ768S4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rph3alQ768S4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rph3alQ768S4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rph3alQ768S4 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rph3alQ768S4 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rph3alQ768S4 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rph3alQ768S4 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rph3alQ768S4 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rph3alQ768S4 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rph3alQ768S4 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rph3alQ768S4 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rph3alQ768S4 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rph3alQ768S4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rph3alQ768S4 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rph3alQ768S4 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rph3alQ768S4 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rph3alQ768S4 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rph3alQ768S4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rph3alQ768S4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rph3alQ768S4 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rph3alQ768S4 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rph3alQ768S4 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rph3alQ768S4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rph3alQ768S4 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rph3alQ768S4 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rph3alQ768S4 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rph3alQ768S4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rph3alQ768S4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rph3alQ768S4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rph3alQ768S4 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rph3alQ768S4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rph3alQ768S4 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rph3alQ768S4 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rph3alQ768S4 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rph3alQ768S4 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rph3alQ768S4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rph3alQ768S4 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rph3alQ768S4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rph3alQ768S4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rph3alQ768S4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rph3alQ768S4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rph3alQ768S4 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rph3alQ768S4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rph3alQ768S4 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rph3alQ768S4 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rph3alQ768S4 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rph3alQ768S4 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rph3alQ768S4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rph3alQ768S4 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rph3alQ768S4 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rph3alQ768S4 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rph3alQ768S4 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rph3alQ768S4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rph3alQ768S4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rph3alQ768S4 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rph3alQ768S4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rph3alQ768S4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rph3alQ768S4 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rph3alQ768S4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rph3alQ768S4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rph3alQ768S4 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rph3alQ768S4 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rph3alQ768S4 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rph3alQ768S4 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rph3alQ768S4 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rph3alQ768S4 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rph3alQ768S4 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rph3alQ768S4 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rph3alQ768S4 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rph3alQ768S4 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rph3alQ768S4 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rph3alQ768S4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rph3alQ768S4 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rph3alQ768S4 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rph3alQ768S4 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Rph3alQ768S4 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rph3alQ768S4 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rph3alQ768S4 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rph3alQ768S4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rph3alQ768S4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rph3alQ768S4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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